276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_44490 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  100 
 
 
311 aa  601  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  60.27 
 
 
311 aa  358  8e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  59.93 
 
 
311 aa  352  5e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  63.45 
 
 
309 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  52.98 
 
 
314 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  52.98 
 
 
314 aa  296  4e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  52.24 
 
 
313 aa  278  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  51.27 
 
 
372 aa  269  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  47.56 
 
 
313 aa  261  8e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  46.03 
 
 
319 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  44.34 
 
 
310 aa  237  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  44.52 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  46.62 
 
 
311 aa  229  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  47.37 
 
 
311 aa  224  1e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  40.89 
 
 
312 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  31.1 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.37 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  30.38 
 
 
320 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.65 
 
 
311 aa  123  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  33.97 
 
 
317 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  32.06 
 
 
309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  31.73 
 
 
318 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  30.75 
 
 
320 aa  119  9e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.94 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  30.19 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  32.48 
 
 
309 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  32.48 
 
 
309 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  33.55 
 
 
306 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.98 
 
 
317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  30.84 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  30.45 
 
 
317 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.17 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  28.53 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  28.53 
 
 
320 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
307 aa  108  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  30.45 
 
 
340 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.71 
 
 
320 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  27.78 
 
 
330 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.97 
 
 
330 aa  107  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.36 
 
 
320 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.9 
 
 
320 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.15 
 
 
332 aa  106  6e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.73 
 
 
320 aa  106  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  32.9 
 
 
309 aa  105  9e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  31.31 
 
 
315 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.04 
 
 
320 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
320 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  29.94 
 
 
318 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.94 
 
 
313 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.62 
 
 
322 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  27.81 
 
 
309 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 
309 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.99 
 
 
325 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.47 
 
 
319 aa  98.6  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  28.12 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  27.48 
 
 
309 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  29.43 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.16 
 
 
318 aa  97.8  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  28.12 
 
 
318 aa  97.1  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.35 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 
318 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  32.64 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.38 
 
 
324 aa  95.1  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.73 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  30.84 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  26.35 
 
 
315 aa  94  3e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  28.21 
 
 
315 aa  92.8  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.18 
 
 
318 aa  92  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.06 
 
 
305 aa  92  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.16 
 
 
314 aa  90.5  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  26.25 
 
 
322 aa  90.5  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  28.89 
 
 
310 aa  89.4  6e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  26.53 
 
 
314 aa  88.6  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  30.32 
 
 
308 aa  89  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.66 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.33 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  28.19 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4474  auxin efflux carrier  29.63 
 
 
321 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.572232  normal  0.0637795 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.66 
 
 
318 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0325  auxin efflux carrier  28.17 
 
 
361 aa  86.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.52 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 
309 aa  85.9  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 
315 aa  85.5  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7177  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 
322 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468538  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  30.16 
 
 
329 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.26 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  27.41 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.7 
 
 
315 aa  84  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  26.37 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  29.26 
 
 
299 aa  82.4  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 
316 aa  79  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  28.25 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  26.33 
 
 
306 aa  77  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  33.63 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 
308 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  29.28 
 
 
322 aa  75.1  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>