More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1536 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  34.49 
 
 
318 aa  169  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  33.02 
 
 
318 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  34.29 
 
 
316 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  33.23 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  30.25 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  32.7 
 
 
313 aa  162  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  31.75 
 
 
318 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  35.2 
 
 
330 aa  162  9e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  33.12 
 
 
318 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  31.43 
 
 
318 aa  158  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  31.43 
 
 
318 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  32.7 
 
 
313 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  31.11 
 
 
318 aa  156  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  31.29 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  31.11 
 
 
318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  33.75 
 
 
316 aa  155  9e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  31.75 
 
 
313 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  30.48 
 
 
318 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  30.48 
 
 
318 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  32.57 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  30.48 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  31.75 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  31.01 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  31.43 
 
 
315 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  30.19 
 
 
319 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  30.48 
 
 
318 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  32.38 
 
 
318 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  30.28 
 
 
316 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  29.13 
 
 
313 aa  139  8.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  30.82 
 
 
318 aa  132  5e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  30.16 
 
 
318 aa  132  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  31.77 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  30.48 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  30.95 
 
 
313 aa  127  3e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  28.25 
 
 
308 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.85 
 
 
307 aa  115  8.999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  26.1 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  26.47 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  28.1 
 
 
309 aa  109  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  28.39 
 
 
316 aa  106  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  30.74 
 
 
312 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  30.37 
 
 
319 aa  103  4e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 
297 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
315 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.65 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 
305 aa  99.8  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.24 
 
 
318 aa  99.8  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 
315 aa  98.6  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  23.93 
 
 
310 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  26.89 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  23.93 
 
 
336 aa  96.3  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 
305 aa  96.3  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  24.57 
 
 
302 aa  96.3  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  28.57 
 
 
306 aa  95.9  8e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  23.61 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  24.57 
 
 
306 aa  95.1  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  23.61 
 
 
304 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  24.41 
 
 
311 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.46 
 
 
350 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  23.13 
 
 
324 aa  93.2  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  31.31 
 
 
309 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  25.8 
 
 
310 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  21.79 
 
 
310 aa  92.4  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  30.33 
 
 
311 aa  92.4  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
305 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  29.22 
 
 
295 aa  90.9  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  28.62 
 
 
319 aa  91.3  2e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.95 
 
 
304 aa  90.5  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  28.63 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  28.24 
 
 
302 aa  90.1  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  28.91 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  24.04 
 
 
300 aa  90.1  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.25 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  25.73 
 
 
308 aa  89.4  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.11 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.62 
 
 
311 aa  89.4  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  26.96 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  26.96 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  22.86 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  27.99 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.25 
 
 
318 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
315 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30.52 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.76 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  22.86 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  22.86 
 
 
336 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  26.26 
 
 
300 aa  87.8  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.65 
 
 
313 aa  87.4  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  25.75 
 
 
301 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 
318 aa  86.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.8 
 
 
320 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.47 
 
 
320 aa  85.9  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.12 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  24.17 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 
320 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>