267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0581 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 307 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  46.28 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  46.38 
 
 		 309 aa  233  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  43.79 
 
 		 306 aa  227  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  42.26 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  49.68 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  47.27 
 
 		 308 aa  218  8.999999999999998e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  43.01 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  40.91 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  42.95 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  41.98 
 
 		 306 aa  205  6e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  40.26 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  44.63 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  35.78 
 
 		 313 aa  191  9e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  34.5 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  40.6 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  43.18 
 
 		 310 aa  182  8.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  38.34 
 
 		 326 aa  179  7e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  41.3 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  33.14 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  36.48 
 
 		 308 aa  152  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  36.08 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  32.31 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 		 314 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.63 
 
 		 314 aa  92.8  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  29.34 
 
 		 322 aa  91.3  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 311 aa  89.4  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 315 aa  88.6  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 		 315 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  29.29 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.69 
 
 		 313 aa  86.7  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  31.02 
 
 		 309 aa  86.3  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  32.86 
 
 		 329 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 		 315 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.82 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  28.25 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  30.34 
 
 		 320 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  27.19 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  28.98 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  28.07 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  28.9 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  31.91 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  29.59 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  28.77 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  29.32 
 
 		 322 aa  78.6  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  30.65 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.2 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.17 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.01 
 
 		 311 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.75 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.47 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.75 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  29.12 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.87 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.37 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  31.88 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  31.01 
 
 		 313 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 308 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  29.59 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  32.58 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  29.64 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 302 aa  68.2  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.77 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.54 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 311 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  28.24 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  29.71 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  28.57 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 342 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.12 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.92 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  31.98 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  30.41 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.92 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.57 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.59 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.85 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>