216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3479 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 309 aa  578  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  45.72 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  46.38 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  46.77 
 
 		 309 aa  233  3e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  45.81 
 
 		 308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  43.04 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  42.3 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  40.51 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  39.49 
 
 		 313 aa  211  1e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  46.48 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  39.94 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  41.69 
 
 		 306 aa  198  7.999999999999999e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  43.85 
 
 		 307 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  38.51 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  40.2 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  43.18 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  37.16 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  43.97 
 
 		 310 aa  172  9e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  37.2 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  37.18 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  36.94 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  33.14 
 
 		 347 aa  129  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 313 aa  101  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  35.23 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 321 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 311 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  30.41 
 
 		 311 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  34.56 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.52 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.12 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29.9 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.31 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  31.51 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  30.17 
 
 		 317 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.14 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  30.43 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  34.45 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.25 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  30.69 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  34.67 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  30 
 
 		 313 aa  75.1  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  31.9 
 
 		 337 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 322 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  28.19 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.87 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.06 
 
 		 320 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.1 
 
 		 322 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.85 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 320 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.9 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.9 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 320 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.1 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  31.67 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.33 
 
 		 315 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  29.37 
 
 		 313 aa  67  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  30.39 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.17 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  30.55 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  32.05 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.1 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 367 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.16 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  32.34 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  32.84 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.15 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 317 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 322 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.25 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.45 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.99 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.76 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.11 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.33 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 350 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  27.27 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  31.43 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.641646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>