183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2397 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 308 aa  568  1e-161  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  49.68 
 
 		 307 aa  236  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  46.47 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  45.86 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  43.69 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  41.04 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  40.91 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  44.41 
 
 		 290 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  43.18 
 
 		 309 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  38.06 
 
 		 307 aa  192  8e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  42.22 
 
 		 307 aa  189  5.999999999999999e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  39.93 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  40.48 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  45.1 
 
 		 310 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  37.74 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  37 
 
 		 326 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  35.26 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  33.55 
 
 		 313 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  39.1 
 
 		 308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  41.83 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  32.51 
 
 		 347 aa  139  6e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  40.31 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  32.65 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  32.65 
 
 		 314 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.33 
 
 		 319 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  29.01 
 
 		 311 aa  86.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.94 
 
 		 311 aa  85.9  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  35.4 
 
 		 313 aa  85.5  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  29.14 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.65 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  29.31 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  28.47 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  32.76 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  29.25 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.74 
 
 		 306 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.06 
 
 		 319 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.58 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.45 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.62 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 317 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.87 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.9 
 
 		 306 aa  61.2  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  27.94 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.7 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  27.87 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.72 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  29.8 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  25.26 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.02 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.39 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  28.35 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.04 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  30.48 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  19.74 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 310 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.04 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.44 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0694  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 347 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  29.04 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  25.4 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.02 
 
 		 337 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.34 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.8 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25.94 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.63 
 
 		 318 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.12 
 
 		 304 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.26 
 
 		 309 aa  53.5  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.63 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  25.9 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.47 
 
 		 329 aa  52.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  30.98 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  20.96 
 
 		 315 aa  52.4  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  27.3 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  25.57 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.62 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  29.65 
 
 		 367 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  26.01 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>