205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17720 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  100 
 
 		 310 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  48.06 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  48.87 
 
 		 309 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  43.32 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  40.84 
 
 		 307 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  45.1 
 
 		 308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  40.91 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  44.22 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  43.97 
 
 		 309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  38.31 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  37.96 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  35.35 
 
 		 314 aa  166  5e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  37.87 
 
 		 307 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  41.9 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  39.67 
 
 		 307 aa  159  8e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  37.7 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  33.01 
 
 		 313 aa  149  6e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  41.08 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  35.78 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  37.45 
 
 		 279 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  30.95 
 
 		 347 aa  109  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  35.69 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  33.11 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  25.39 
 
 		 332 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.94 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.72 
 
 		 313 aa  73.9  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  22.58 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.95 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.6 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.04 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.58 
 
 		 320 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  28.76 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 308 aa  70.9  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  33.99 
 
 		 313 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.4 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  31.12 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  29.17 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.18 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  30.46 
 
 		 311 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  28.78 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  28.74 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 318 aa  65.9  0.0000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  26.88 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.54 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  32.24 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  28.36 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.85 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.03 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.55 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.72 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 		 320 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 		 322 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.57 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  30.79 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.64 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  30.79 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0068  Auxin Efflux Carrier  29.56 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.723406  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  28.63 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  28.21 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  36.29 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  28.28 
 
 		 317 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  35.29 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  30.21 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  27.2 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.26 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  27.59 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  27.78 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 322 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  29.01 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.21 
 
 		 309 aa  57  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  27.34 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.24 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.52 
 
 		 372 aa  57  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  18.98 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  35.29 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.71 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>