222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3083 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  100 
 
 		 291 aa  567  1e-161  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  98.63 
 
 		 291 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  95.53 
 
 		 291 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  88.32 
 
 		 291 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  63.79 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  48.8 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  54.3 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  53.26 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  50 
 
 		 291 aa  261  6e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  41.46 
 
 		 294 aa  192  7e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  36.59 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  38.06 
 
 		 295 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  31.6 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  35.81 
 
 		 293 aa  145  8.000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  35.27 
 
 		 293 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  38.33 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  38.33 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  33.45 
 
 		 291 aa  138  1e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  37.63 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  31.62 
 
 		 295 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  30.61 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  29.97 
 
 		 294 aa  121  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  29.19 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  29.83 
 
 		 304 aa  115  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  29.25 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  30.82 
 
 		 302 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  30.69 
 
 		 297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  30.8 
 
 		 291 aa  103  3e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  27.49 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.48 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 		 297 aa  99.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.17 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 302 aa  90.9  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  34.38 
 
 		 302 aa  90.5  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  29.26 
 
 		 312 aa  86.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  26.79 
 
 		 310 aa  75.9  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  30.34 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  30.51 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.91 
 
 		 316 aa  70.9  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  32.2 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  30.18 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.26 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  30.07 
 
 		 322 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.12 
 
 		 312 aa  65.5  0.0000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  28.52 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  23.83 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 313 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  27.64 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.75 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 316 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 328 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.15 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.04 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.58 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.67 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.67 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 315 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.67 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.48 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.66 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  29.76 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.99 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.91 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  27.92 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  30.48 
 
 		 319 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25.93 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  28.42 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  28.06 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  27.37 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.83 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  27.5 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  28 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 311 aa  56.6  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.23 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  25.39 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>