219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2219 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 312 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  39.42 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  36.9 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  39.31 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  36.69 
 
 		 309 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  38.12 
 
 		 306 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  34.68 
 
 		 307 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  37.92 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  36.75 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  37.58 
 
 		 308 aa  142  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  38.11 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  40.44 
 
 		 308 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  37.18 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  32.84 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  38.24 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  30.07 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  38.57 
 
 		 279 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.05 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  30.53 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  34.39 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  31.46 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.08 
 
 		 317 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  37.58 
 
 		 310 aa  99.8  6e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  32.59 
 
 		 310 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.23 
 
 		 315 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 315 aa  89.4  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  30.96 
 
 		 314 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  31.63 
 
 		 317 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  32.59 
 
 		 309 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.74 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.03 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.99 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  31.58 
 
 		 309 aa  82.8  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  31.08 
 
 		 319 aa  82.4  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  30.41 
 
 		 311 aa  82  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.63 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  31.37 
 
 		 372 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.03 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.33 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.76 
 
 		 318 aa  77.8  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  26.52 
 
 		 322 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  28.75 
 
 		 311 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.35 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  28.53 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.25 
 
 		 318 aa  76.3  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  28.03 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.62 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  29.34 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.77 
 
 		 313 aa  73.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  28.93 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.68 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.87 
 
 		 313 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  29.55 
 
 		 377 aa  66.2  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.6 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.58 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.39 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.07 
 
 		 322 aa  64.7  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  29.15 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 311 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  27.13 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3639  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 306 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.02 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.14 
 
 		 320 aa  63.2  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.44 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  25.39 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  23.37 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  22.33 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  27.5 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.83 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 319 aa  60.8  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>