190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1014 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
306 aa  582  1.0000000000000001e-165  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  43.65 
 
 
313 aa  270  2e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  48.2 
 
 
306 aa  262  4.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  43.13 
 
 
314 aa  256  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  45.98 
 
 
309 aa  241  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  44.26 
 
 
307 aa  214  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  45.34 
 
 
308 aa  210  2e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  41.83 
 
 
307 aa  209  6e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  41.84 
 
 
308 aa  205  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  40.97 
 
 
307 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  37.66 
 
 
307 aa  198  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  40.35 
 
 
290 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  41.1 
 
 
309 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  42.9 
 
 
309 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  41.6 
 
 
279 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  39.94 
 
 
326 aa  186  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  40.97 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  44.12 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  37.16 
 
 
305 aa  171  1e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  40 
 
 
308 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  36.42 
 
 
347 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  37.5 
 
 
312 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  32.89 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  31.25 
 
 
314 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  31.02 
 
 
314 aa  103  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  32.2 
 
 
311 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  31.56 
 
 
311 aa  100  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 
317 aa  86.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  32.99 
 
 
313 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  31.12 
 
 
302 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  29.51 
 
 
309 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  30.23 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
310 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  28.85 
 
 
311 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  28.33 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  30.58 
 
 
372 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  28.8 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.39 
 
 
311 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.47 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  30.85 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  30.85 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.91 
 
 
312 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  30.03 
 
 
317 aa  72.4  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.94 
 
 
318 aa  72  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 
318 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  32.84 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  28.77 
 
 
307 aa  67.4  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.79 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  29.86 
 
 
320 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
322 aa  67  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.02 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  29.7 
 
 
311 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0068  Auxin Efflux Carrier  32.61 
 
 
302 aa  64.7  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.723406  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  30.03 
 
 
367 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  28.16 
 
 
304 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  32.01 
 
 
302 aa  64.3  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.7 
 
 
309 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  25.65 
 
 
318 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  26.69 
 
 
313 aa  63.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  28.24 
 
 
314 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  29.6 
 
 
322 aa  63.5  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  27.41 
 
 
302 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  26.01 
 
 
295 aa  62.8  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  27.59 
 
 
313 aa  62.8  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  30.1 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  28.77 
 
 
320 aa  62.4  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.74 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.26 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  29.15 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.74 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.5 
 
 
330 aa  62  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  27.46 
 
 
313 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  24.05 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.26 
 
 
293 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  27.74 
 
 
317 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.74 
 
 
318 aa  61.6  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.39 
 
 
330 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  25.27 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  25.09 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  24.18 
 
 
320 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  29.7 
 
 
340 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.39 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  28.24 
 
 
317 aa  59.3  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  28.18 
 
 
315 aa  59.3  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
315 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25 
 
 
320 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  30.1 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  26.41 
 
 
309 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  27.21 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  29.49 
 
 
327 aa  58.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.86 
 
 
320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.21 
 
 
313 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.27 
 
 
310 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  27.63 
 
 
311 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  26.87 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>