192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1613 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1613  permease  100 
 
 
314 aa  624  1e-178  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  81.35 
 
 
313 aa  513  1e-144  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  43.23 
 
 
306 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  37.94 
 
 
306 aa  237  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  39.94 
 
 
309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  38.36 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  35.88 
 
 
308 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  37.87 
 
 
307 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  34.19 
 
 
307 aa  186  4e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  35.67 
 
 
309 aa  185  9e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  33.44 
 
 
307 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  37.78 
 
 
309 aa  181  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  37.33 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  36.74 
 
 
308 aa  178  9e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  36.92 
 
 
279 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  33.13 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  32.7 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  31.07 
 
 
305 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  35.26 
 
 
308 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  34.39 
 
 
310 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  29.14 
 
 
347 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  27.96 
 
 
312 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.97 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.64 
 
 
318 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.48 
 
 
318 aa  90.5  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 
318 aa  90.1  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.06 
 
 
318 aa  89  9e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.06 
 
 
318 aa  89  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.75 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.33 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.21 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.63 
 
 
320 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  27.3 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.63 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.82 
 
 
311 aa  83.6  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.59 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.65 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  27.51 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.25 
 
 
322 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  25.77 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.33 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.81 
 
 
320 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.5 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.5 
 
 
320 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.58 
 
 
332 aa  75.9  0.0000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
325 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  27.91 
 
 
320 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.23 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  24.55 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  27.24 
 
 
320 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  26.01 
 
 
312 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.14 
 
 
302 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.01 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  23.31 
 
 
312 aa  68.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  24.25 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  23.31 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.37 
 
 
317 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  25.17 
 
 
309 aa  66.2  0.0000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  25.73 
 
 
309 aa  65.9  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.87 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  24.58 
 
 
314 aa  64.7  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  23.71 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  25.25 
 
 
315 aa  63.2  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.6 
 
 
310 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
314 aa  62.8  0.000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.44 
 
 
321 aa  62.8  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  24.49 
 
 
310 aa  62.4  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
372 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  25.84 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  23.7 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.18 
 
 
302 aa  61.6  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  24.01 
 
 
315 aa  60.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  23.45 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  25.52 
 
 
313 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  23.08 
 
 
302 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1197  auxin efflux carrier  25.32 
 
 
322 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.793167  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  26.06 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  22.95 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  23.23 
 
 
311 aa  57.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  29.47 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  24.03 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  23.32 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  24.07 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  26.14 
 
 
303 aa  57  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 
310 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
329 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  23.41 
 
 
292 aa  56.2  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  28.23 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  24.44 
 
 
318 aa  55.5  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  25.49 
 
 
303 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  23.7 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  23.32 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  23.05 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>