264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3888 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  100 
 
 		 307 aa  598  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  82.41 
 
 		 308 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19050  predicted permease  52.62 
 
 		 326 aa  288  7e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.975831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  46.25 
 
 		 306 aa  247  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  45.73 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3295  Auxin Efflux Carrier  42.39 
 
 		 309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  42.72 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  41.2 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  42.26 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  40.26 
 
 		 307 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  39.87 
 
 		 305 aa  203  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  41.84 
 
 		 306 aa  199  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1613  permease  37.87 
 
 		 314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.734306  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  36.66 
 
 		 313 aa  196  3e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  40.2 
 
 		 309 aa  191  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  38.02 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2397  Auxin Efflux Carrier  41.08 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3860  Auxin Efflux Carrier  38.44 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  40.84 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  35.6 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  31.5 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  34.06 
 
 		 312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  29.9 
 
 		 314 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.04 
 
 		 319 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  28.48 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 320 aa  100  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.96 
 
 		 320 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.73 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 320 aa  95.1  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.94 
 
 		 315 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  27.06 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.94 
 
 		 315 aa  94  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  27.45 
 
 		 332 aa  92.8  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  29 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  29.35 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  29.35 
 
 		 309 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  31.76 
 
 		 297 aa  86.3  6e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 314 aa  86.3  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.01 
 
 		 315 aa  86.3  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  28.25 
 
 		 311 aa  85.5  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 322 aa  85.5  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  26.4 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  23.47 
 
 		 325 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  29.14 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  29.39 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.89 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  27.2 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1422  auxin efflux carrier  29.83 
 
 		 320 aa  80.9  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0882088  normal  0.0189888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  25.73 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 318 aa  78.6  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.99 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  28.38 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2077  Auxin Efflux Carrier  29.27 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.393578  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  35.4 
 
 		 308 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  28.38 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.67 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.46 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 309 aa  72.8  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.46 
 
 		 318 aa  72.4  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  26.78 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.57 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0109  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  28.14 
 
 		 320 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  27.46 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.45 
 
 		 313 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  23.57 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 		 337 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  36.15 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.03 
 
 		 372 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.51 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.84 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 308 aa  69.7  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  28 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  30.46 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2616  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.699777 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2607  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.10012  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  24.65 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.43 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  24.83 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2945  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.07 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  30.19 
 
 		 340 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3774  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0115571 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.45 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  29.62 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3915  auxin efflux carrier  24.07 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>