226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2782 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  100 
 
 		 291 aa  569  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  95.53 
 
 		 291 aa  520  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  95.53 
 
 		 291 aa  520  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  88.66 
 
 		 291 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  63.45 
 
 		 296 aa  319  3e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  54.64 
 
 		 295 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  54.98 
 
 		 295 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  47.77 
 
 		 291 aa  272  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  49.28 
 
 		 291 aa  258  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  41.11 
 
 		 294 aa  190  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  38.41 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  37.28 
 
 		 293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  35.29 
 
 		 293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  31.25 
 
 		 291 aa  145  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  34.26 
 
 		 293 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  37.98 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  37.98 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  32.03 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  37.28 
 
 		 295 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  31.96 
 
 		 295 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  30.61 
 
 		 295 aa  129  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  32.76 
 
 		 297 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  27.7 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  30.82 
 
 		 302 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  29.29 
 
 		 294 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.81 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  29.01 
 
 		 293 aa  112  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  30.69 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  27.59 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.28 
 
 		 301 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 		 297 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.96 
 
 		 326 aa  92.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  27.42 
 
 		 302 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  30.48 
 
 		 312 aa  90.9  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  32.46 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  30.95 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  27.65 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  30.95 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30.32 
 
 		 319 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  30.18 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 296 aa  70.5  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.72 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  26.9 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  26.9 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  28.03 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.5 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  29.18 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  29.14 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 307 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  26.21 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.83 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  23.81 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.33 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.33 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.33 
 
 		 318 aa  62.4  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.99 
 
 		 322 aa  62.4  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 316 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  28.85 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  28.87 
 
 		 316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  27.57 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.41 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 		 314 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  27.92 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  26.53 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 305 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  24.5 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.26 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.23 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 313 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  29.76 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  25.41 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.53 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.86 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  24.43 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.66 
 
 		 313 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  25.2 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.34 
 
 		 317 aa  55.8  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  26.74 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>