184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0121 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  100 
 
 		 303 aa  578  1e-164  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  93.4 
 
 		 307 aa  498  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  58.14 
 
 		 301 aa  293  2e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  50.17 
 
 		 302 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  30.33 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  34.03 
 
 		 310 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  31.56 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  32.11 
 
 		 297 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  30.95 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  29.67 
 
 		 297 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  29.93 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  29.33 
 
 		 297 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.07 
 
 		 301 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  30.17 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  29.06 
 
 		 312 aa  86.3  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 311 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  34.41 
 
 		 302 aa  85.1  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30.72 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.83 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  30.53 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  27.76 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  28.97 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  26.22 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  26.41 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25.61 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.96 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.61 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  31.46 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  31.4 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25.26 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  25.26 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  31.72 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  30.18 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.29 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  30.23 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  29.77 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  27.21 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.91 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.41 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.84 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  28.93 
 
 		 322 aa  66.2  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  27.67 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  28.9 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.34 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.31 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3677  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  29.47 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.24 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.3 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  26.42 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  26.8 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 295 aa  59.3  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.54 
 
 		 317 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.1 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  26.55 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.28 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  31.44 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  27.06 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  27.38 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  33.33 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  25.17 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 320 aa  55.8  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 337 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  22.9 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  25.83 
 
 		 292 aa  55.1  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  25.43 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25.26 
 
 		 296 aa  53.5  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  23.81 
 
 		 294 aa  53.5  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.49 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.71 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 324 aa  52.4  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  23.68 
 
 		 326 aa  52.4  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  29.47 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  29.58 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  23.77 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.37 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  29.37 
 
 		 295 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.59 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.37 
 
 		 320 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  28.44 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.7 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  30 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 342 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 342 aa  51.6  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>