203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3571 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  100 
 
 
295 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  96.95 
 
 
295 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  56.36 
 
 
291 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  61.72 
 
 
296 aa  323  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  54.98 
 
 
291 aa  297  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  54.3 
 
 
291 aa  295  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  53.95 
 
 
291 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  50.17 
 
 
291 aa  290  2e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  52.9 
 
 
291 aa  281  1e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  38.33 
 
 
294 aa  176  5e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  35.66 
 
 
295 aa  172  9e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  37.8 
 
 
293 aa  169  7e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  38.25 
 
 
295 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  38.25 
 
 
295 aa  148  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  37.54 
 
 
295 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  30.51 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  31.72 
 
 
295 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  29.25 
 
 
294 aa  123  4e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  30 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
293 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  28.27 
 
 
291 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  27.99 
 
 
304 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  29.01 
 
 
293 aa  105  8e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  29.15 
 
 
292 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  27.6 
 
 
295 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  30.14 
 
 
291 aa  97.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.67 
 
 
302 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.82 
 
 
301 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  34.23 
 
 
297 aa  87.4  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  27.14 
 
 
326 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  29.2 
 
 
297 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  30.21 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  28.46 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  29.83 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  29.37 
 
 
301 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.75 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.62 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.31 
 
 
301 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  29.15 
 
 
307 aa  72.4  0.000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  29.73 
 
 
308 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  31.98 
 
 
307 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.81 
 
 
313 aa  70.9  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.41 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.27 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  27.42 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.41 
 
 
310 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  26.33 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  27.72 
 
 
314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  29.41 
 
 
302 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.81 
 
 
316 aa  64.3  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.67 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 
312 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
304 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.4 
 
 
330 aa  63.5  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  25.54 
 
 
309 aa  63.2  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 
325 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.78 
 
 
319 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.58 
 
 
312 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  28.67 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25 
 
 
296 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.16 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  29.41 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.13 
 
 
307 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  26.4 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 
318 aa  60.5  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 
318 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  30.48 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  26.55 
 
 
306 aa  59.7  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  27.05 
 
 
306 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  27.14 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17720  predicted permease  27.01 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.302004  normal  0.264238 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.19 
 
 
312 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.63 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  30.11 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  27.32 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  34.03 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  24.88 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 
318 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.36 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  28.93 
 
 
309 aa  57.4  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25.84 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 
311 aa  57  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  27.09 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25.85 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.37 
 
 
309 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.84 
 
 
305 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.5 
 
 
299 aa  56.2  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  23.92 
 
 
305 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  22.99 
 
 
315 aa  55.8  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25.84 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  25.84 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  22.36 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>