112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003704 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  81.85 
 
 		 292 aa  487  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  71.82 
 
 		 291 aa  374  1e-102  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  39.04 
 
 		 291 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  37.5 
 
 		 295 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  36.59 
 
 		 295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  34.27 
 
 		 291 aa  175  7e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  36.93 
 
 		 295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  35.64 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  35.71 
 
 		 293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  30.64 
 
 		 304 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  32.33 
 
 		 291 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  29.25 
 
 		 291 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  31.27 
 
 		 296 aa  106  6e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 291 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  29.29 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 297 aa  95.9  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  32.2 
 
 		 294 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  27.08 
 
 		 326 aa  93.6  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  27.99 
 
 		 295 aa  92  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  30.21 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  29.01 
 
 		 295 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.71 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.71 
 
 		 295 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  32.12 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  28.53 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  29.69 
 
 		 325 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  28.32 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.45 
 
 		 302 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  20.91 
 
 		 297 aa  69.7  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  20.91 
 
 		 297 aa  69.3  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.49 
 
 		 302 aa  68.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  26.23 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  29.55 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.9 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.27 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  26.7 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  21.43 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  24.03 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  25.97 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 317 aa  53.9  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 303 aa  53.9  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 303 aa  53.5  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  24.38 
 
 		 302 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  24.15 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.93 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.25 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 318 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  23.89 
 
 		 300 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  26.25 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1225  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.36 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000182146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 311 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  23.3 
 
 		 309 aa  50.4  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.26 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.03 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.03 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.03 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  24.36 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12560  predicted permease  27.18 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.270309  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.17 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  29.53 
 
 		 306 aa  47.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  26.15 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  23.34 
 
 		 314 aa  46.6  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 309 aa  46.2  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  22.6 
 
 		 311 aa  46.2  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.6 
 
 		 308 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.15 
 
 		 311 aa  45.8  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  23.05 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  23.81 
 
 		 362 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  22.19 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 		 312 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  25 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  23.9 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  26.75 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  26.42 
 
 		 306 aa  44.3  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5424  Auxin Efflux Carrier  26.16 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 311 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>