107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0706 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
326 aa  645    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  26.45 
 
 
295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  27.01 
 
 
291 aa  113  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0707  Auxin Efflux Carrier  28.29 
 
 
335 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  28.17 
 
 
291 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  27.56 
 
 
291 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  26.9 
 
 
295 aa  99.8  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.58 
 
 
295 aa  95.9  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  24.61 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  26.46 
 
 
292 aa  94  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  27.08 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  28.16 
 
 
304 aa  90.9  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
291 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.38 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  24.68 
 
 
295 aa  87  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  23.64 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
291 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  27.4 
 
 
294 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  26.56 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  25.94 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  26.35 
 
 
312 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  23.22 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.96 
 
 
293 aa  76.6  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  24.75 
 
 
295 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28 
 
 
302 aa  74.3  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.75 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.75 
 
 
295 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  27.39 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  25.54 
 
 
296 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 
297 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.58 
 
 
301 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
302 aa  67  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  25.23 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23.87 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  23.2 
 
 
305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  25.99 
 
 
295 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  22.88 
 
 
305 aa  63.9  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  22.62 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  23.86 
 
 
305 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  22.88 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  22.88 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  24.82 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  22.55 
 
 
305 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  25.77 
 
 
310 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  21.97 
 
 
305 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  22.92 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  25.47 
 
 
291 aa  60.8  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.32 
 
 
304 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  22.22 
 
 
305 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  26.51 
 
 
294 aa  58.9  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.56 
 
 
320 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  26.81 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  24.25 
 
 
302 aa  54.7  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  30.07 
 
 
308 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.63 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  23.38 
 
 
322 aa  54.7  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 
325 aa  54.3  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.86 
 
 
304 aa  53.5  0.000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  25.45 
 
 
307 aa  53.5  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.03 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  24 
 
 
302 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 
302 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.1 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  23.51 
 
 
294 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  22.59 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  26.3 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  23.6 
 
 
305 aa  49.3  0.00008  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  23.48 
 
 
309 aa  49.3  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 
328 aa  48.5  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  23.97 
 
 
350 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  22.94 
 
 
307 aa  48.1  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  22.61 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  23.79 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  27.17 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  27.17 
 
 
349 aa  47.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.55 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  22.86 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  25.23 
 
 
312 aa  47.4  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  24.53 
 
 
330 aa  47  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  23.92 
 
 
311 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  29.46 
 
 
310 aa  47  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  21.6 
 
 
304 aa  46.6  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  22.42 
 
 
314 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  23.03 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  22.31 
 
 
311 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  23.15 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
312 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  23.93 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  21.81 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  24.14 
 
 
319 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  23.28 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3479  Auxin Efflux Carrier  26.7 
 
 
309 aa  44.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  22.53 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 
306 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  25.68 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  27.45 
 
 
310 aa  43.9  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  21.81 
 
 
302 aa  43.9  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  22.84 
 
 
317 aa  43.9  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>