241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3176 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  100 
 
 		 310 aa  596  1e-169  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  87.06 
 
 		 307 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  48.1 
 
 		 310 aa  223  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  35.88 
 
 		 302 aa  166  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  34.19 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  33.55 
 
 		 301 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  34.95 
 
 		 312 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  35.67 
 
 		 297 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  31.77 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  31.44 
 
 		 297 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  33.12 
 
 		 319 aa  127  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  32.89 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  30 
 
 		 302 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  31.33 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  33.57 
 
 		 302 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  31.54 
 
 		 302 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  31.49 
 
 		 303 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  27.91 
 
 		 292 aa  102  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  26.92 
 
 		 305 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  29.53 
 
 		 291 aa  99  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  25.89 
 
 		 305 aa  99  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  30 
 
 		 291 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  26.22 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  26.57 
 
 		 305 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  25.89 
 
 		 305 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  30.84 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  28.3 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25.87 
 
 		 305 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 291 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.23 
 
 		 304 aa  92.8  6e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.87 
 
 		 307 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  29.74 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.62 
 
 		 318 aa  89.7  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  26.85 
 
 		 293 aa  89.4  6e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.08 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 318 aa  88.2  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.95 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  28.05 
 
 		 295 aa  87  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  29.69 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  30.84 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.11 
 
 		 302 aa  86.3  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.56 
 
 		 326 aa  85.9  9e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  29.64 
 
 		 291 aa  85.1  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.3 
 
 		 318 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.13 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  27.81 
 
 		 312 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  29.45 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  23.71 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  27.41 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.81 
 
 		 318 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  29.33 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  28.33 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  29.06 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 301 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  31.83 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  28.8 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  29.86 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.28 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  27.11 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  32.09 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.48 
 
 		 330 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 310 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  25.48 
 
 		 304 aa  67  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.59 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  29.37 
 
 		 300 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.6 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.59 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  29.65 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  24 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  29.62 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.05 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  24.65 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25.24 
 
 		 305 aa  62  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  29.3 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.6 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  27.14 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.06 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.06 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3872  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.647471  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  21.31 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  27.24 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>