199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1994 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
312 aa  598  1e-170  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  61.41 
 
 
297 aa  311  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  44.95 
 
 
297 aa  242  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  44.95 
 
 
297 aa  240  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  43.37 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  42.35 
 
 
301 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  38.1 
 
 
302 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  33.56 
 
 
295 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  31.15 
 
 
302 aa  106  4e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  33.55 
 
 
293 aa  106  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  32.76 
 
 
310 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  32.63 
 
 
310 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  29.71 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2903  auxin efflux carrier  30.72 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.788833  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  30.29 
 
 
291 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  29.48 
 
 
322 aa  95.1  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  29.87 
 
 
291 aa  92.8  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  30.48 
 
 
291 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  29.9 
 
 
291 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  32.56 
 
 
302 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.95 
 
 
326 aa  89.4  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
291 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  28.92 
 
 
319 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  29.33 
 
 
291 aa  86.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  29.81 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  29.77 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  28.21 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23880  membrane protein  32.4 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
293 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  28.34 
 
 
296 aa  80.5  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  29.64 
 
 
291 aa  80.5  0.00000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  27.54 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  29.06 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  28.03 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  27.92 
 
 
293 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  26.23 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  28.08 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  26.23 
 
 
305 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  28.08 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
295 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.73 
 
 
313 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.08 
 
 
318 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  26.93 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.9 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.77 
 
 
295 aa  72.8  0.000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  26.1 
 
 
318 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  25.25 
 
 
305 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.06 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  25.57 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  25.25 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.76 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
294 aa  67.8  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  28.43 
 
 
309 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0851  hypothetical protein  27.56 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.180241  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  29.77 
 
 
295 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  29.8 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.66 
 
 
319 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  28.76 
 
 
306 aa  64.3  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  31.43 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 
314 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.47 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  31.27 
 
 
308 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  24.21 
 
 
314 aa  59.7  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  30.93 
 
 
315 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
307 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  25.38 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.66 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  27.4 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.74 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.91 
 
 
310 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.71 
 
 
330 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  24.09 
 
 
318 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  28.9 
 
 
300 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.65 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.68 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
336 aa  56.2  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  23.58 
 
 
312 aa  56.2  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  55.8  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  26.01 
 
 
308 aa  55.8  0.0000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.38 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  28.43 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.79 
 
 
304 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  30.77 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  27.65 
 
 
317 aa  54.7  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  27.08 
 
 
316 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30.03 
 
 
305 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.62 
 
 
305 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>