159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03581 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  100 
 
 		 305 aa  589  1e-167  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  37.09 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  38.08 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  37.02 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  38.28 
 
 		 301 aa  178  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  38.05 
 
 		 298 aa  176  6e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  42.86 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  33.89 
 
 		 299 aa  168  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  34.56 
 
 		 300 aa  156  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  35.76 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  35.17 
 
 		 301 aa  151  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  34.71 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  35.66 
 
 		 298 aa  136  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  30.99 
 
 		 303 aa  136  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  35.25 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  31.32 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  35.44 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  32.53 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  32.19 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  32.19 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  32.19 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  32.19 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  32.19 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  32.19 
 
 		 299 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.17 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  32.94 
 
 		 315 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.78 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.5 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  30.52 
 
 		 304 aa  89.4  7e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  27.08 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  31.47 
 
 		 305 aa  86.7  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  29.29 
 
 		 304 aa  83.6  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  32.02 
 
 		 318 aa  82.8  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 304 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  25.93 
 
 		 306 aa  82  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.95 
 
 		 306 aa  79  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.75 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  23.41 
 
 		 303 aa  77  0.0000000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  25.43 
 
 		 315 aa  75.9  0.0000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  30.77 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  32.62 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.37 
 
 		 297 aa  72.8  0.000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.28 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.84 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  22.84 
 
 		 296 aa  67  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  27.74 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  24.55 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.04 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 316 aa  65.1  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  29.44 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  29.03 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  24.74 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  27.1 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  26.64 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  24.65 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  26.86 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  23.69 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  36.89 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  23.34 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  24.42 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25.83 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  26.12 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  34.26 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  24.91 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  29.91 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  24.82 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  24.21 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.75 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.18 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  27.16 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  26.32 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  24.16 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  20.73 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.68 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.16 
 
 		 305 aa  54.3  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  25.68 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  27.48 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  24.16 
 
 		 325 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  28.7 
 
 		 314 aa  52.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 325 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  23.47 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  31.19 
 
 		 299 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  23.47 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 322 aa  52  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  19.75 
 
 		 320 aa  52  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  28.21 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  23.47 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  28.11 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  25.9 
 
 		 307 aa  51.6  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>