146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_13080 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  100 
 
 		 317 aa  631  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  37.99 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  31.33 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  32.18 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  30.91 
 
 		 306 aa  149  4e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  29.28 
 
 		 305 aa  149  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  28.71 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  31.7 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  27.76 
 
 		 312 aa  103  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  26.29 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  25.9 
 
 		 349 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.72 
 
 		 320 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 306 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 361 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  27.85 
 
 		 306 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25 
 
 		 312 aa  87.4  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 328 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  25 
 
 		 314 aa  85.9  9e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  27.93 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.81 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.03 
 
 		 316 aa  83.6  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.87 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.61 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  25.65 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  21.77 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.33 
 
 		 304 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  24.62 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.94 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.27 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.59 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  24.76 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  23.64 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.85 
 
 		 320 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.85 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  26.23 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  26.14 
 
 		 320 aa  62  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.31 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  23.62 
 
 		 311 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  21.12 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.78 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  23.38 
 
 		 316 aa  59.7  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.83 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  23.15 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  27.04 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  23.41 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  24.12 
 
 		 313 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.51 
 
 		 301 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  26.1 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  22.83 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  21.82 
 
 		 302 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  25.29 
 
 		 337 aa  53.9  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  26.56 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  23.77 
 
 		 353 aa  53.5  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  22.51 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  21.94 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  26.1 
 
 		 320 aa  52.8  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 		 320 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  22.33 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  26.98 
 
 		 377 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  28.11 
 
 		 305 aa  51.2  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  20.27 
 
 		 308 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  24.1 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  25.74 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  26.45 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 319 aa  49.3  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  23.79 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  21.62 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  21.62 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  21.28 
 
 		 318 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  22.3 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  21.62 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  22.47 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  22.41 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  25.63 
 
 		 320 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  21.82 
 
 		 291 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  23.94 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  23.2 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>