78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1289 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
324 aa  614  1e-175  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  44.41 
 
 
308 aa  227  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  34.31 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  33.99 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.98 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  29.85 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  28.14 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  32.54 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  31.75 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  30.37 
 
 
313 aa  68.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  28.16 
 
 
301 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  29.11 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  30.48 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  25.94 
 
 
301 aa  65.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  32.43 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  28.3 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  29.49 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  25.69 
 
 
303 aa  60.5  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.38 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.5 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  30.26 
 
 
315 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.98 
 
 
302 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  28.44 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.02 
 
 
310 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  28.5 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  30.11 
 
 
303 aa  55.8  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.93 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  27.78 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  26.37 
 
 
300 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.7 
 
 
298 aa  54.3  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.87 
 
 
308 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  22.22 
 
 
309 aa  53.1  0.000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.19 
 
 
301 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  27.09 
 
 
301 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 
299 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 
298 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  23.64 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 
302 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.13 
 
 
296 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  30.33 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  23.04 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.24 
 
 
306 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.59 
 
 
301 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.13 
 
 
296 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  25 
 
 
327 aa  49.7  0.00008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  26.74 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.11 
 
 
297 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.08 
 
 
315 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  29.44 
 
 
297 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
330 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.76 
 
 
320 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  25.91 
 
 
299 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.79 
 
 
361 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  29.61 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.65 
 
 
325 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  22.57 
 
 
324 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  29.44 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  26.21 
 
 
305 aa  46.2  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  27.84 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.77 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.18 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  26.42 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  27.84 
 
 
299 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  26.15 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.69 
 
 
305 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  28.35 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  26.57 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  28.35 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  28.35 
 
 
337 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  26.05 
 
 
302 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  28.23 
 
 
290 aa  43.5  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  26.21 
 
 
305 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  31 
 
 
315 aa  42.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>