68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II2100 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  100 
 
 		 299 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  94.31 
 
 		 299 aa  517  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  93.98 
 
 		 337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  93.98 
 
 		 299 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  93.98 
 
 		 337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  93.98 
 
 		 299 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  93.98 
 
 		 337 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  37.76 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  37.16 
 
 		 301 aa  185  9e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  35.79 
 
 		 301 aa  182  6e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  36.73 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  36.91 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  36.91 
 
 		 302 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  35.03 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  26.95 
 
 		 303 aa  133  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  34.86 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  32.53 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  27.67 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  30.82 
 
 		 300 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  30.56 
 
 		 302 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 		 302 aa  103  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  24.08 
 
 		 302 aa  97.4  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.72 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  24.38 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.74 
 
 		 301 aa  72  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  21.99 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.67 
 
 		 302 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.2 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.59 
 
 		 304 aa  63.5  0.000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.98 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  20.89 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.02 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  21.34 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  20.55 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 308 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  31.05 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.07 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  23.3 
 
 		 361 aa  49.7  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.99 
 
 		 315 aa  49.3  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  21.03 
 
 		 314 aa  49.3  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25.1 
 
 		 317 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.3 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.71 
 
 		 312 aa  47.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  23.77 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  20.51 
 
 		 303 aa  47.4  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  22.98 
 
 		 321 aa  46.2  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 313 aa  46.2  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  22.86 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  25.52 
 
 		 297 aa  46.2  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  34.55 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  34.55 
 
 		 336 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  32.73 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.3 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  27.83 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  32.73 
 
 		 336 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  25.55 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.51 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2022  Auxin Efflux Carrier  27.43 
 
 		 297 aa  42.7  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  34 
 
 		 339 aa  42.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  21.55 
 
 		 318 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  23.47 
 
 		 315 aa  42.4  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>