107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0419 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  100 
 
 
327 aa  640    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  44.75 
 
 
314 aa  272  5.000000000000001e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  45.57 
 
 
321 aa  263  2e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  34.46 
 
 
312 aa  192  5e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  31.83 
 
 
315 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  34.82 
 
 
297 aa  179  4e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  32.31 
 
 
315 aa  169  5e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  32.62 
 
 
315 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  28.75 
 
 
316 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  28.61 
 
 
328 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.55 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.99 
 
 
305 aa  92  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.32 
 
 
325 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.22 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.77 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 
312 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.62 
 
 
317 aa  70.5  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.69 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25.48 
 
 
295 aa  67.4  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.23 
 
 
304 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  26.06 
 
 
362 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.61 
 
 
310 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.03 
 
 
306 aa  62.4  0.000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.5 
 
 
302 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.24 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.86 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.56 
 
 
313 aa  60.1  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.33 
 
 
307 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  27.27 
 
 
312 aa  58.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.43 
 
 
310 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  21.91 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  26.39 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  21.6 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.05 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  23.1 
 
 
293 aa  55.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  24.54 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  23.59 
 
 
300 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2219  Auxin Efflux Carrier  30 
 
 
312 aa  53.5  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
301 aa  53.1  0.000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  22.84 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 
309 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  26.05 
 
 
300 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.43 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.43 
 
 
318 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23.01 
 
 
301 aa  50.8  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  21.5 
 
 
315 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.43 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25 
 
 
317 aa  49.7  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.3 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  22.54 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  23.05 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  23.32 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  22.74 
 
 
318 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 
320 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  25.56 
 
 
313 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
315 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  28.82 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  22.54 
 
 
318 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  28.65 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  22.16 
 
 
328 aa  47.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  22.91 
 
 
318 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  26.14 
 
 
318 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.41 
 
 
318 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.21 
 
 
302 aa  47  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  28.77 
 
 
318 aa  46.6  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  24.06 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  29.59 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  22.4 
 
 
318 aa  46.6  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  22.5 
 
 
321 aa  46.2  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
302 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  22.6 
 
 
318 aa  46.2  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  30.41 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  23.12 
 
 
330 aa  45.4  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  22.6 
 
 
318 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  23.15 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  21.52 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  25.34 
 
 
302 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  20.97 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.08 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  22.78 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  26.47 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  23.77 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  26.47 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  26.47 
 
 
314 aa  44.3  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1285  Auxin Efflux Carrier  26.47 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  25.69 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  22.4 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2659  putative transporter YfdV  26.47 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1297  putative transporter YfdV  26.47 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2522  putative transporter YfdV  26.47 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2741  putative transporter YfdV  26.47 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.705582  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3604  putative transporter YfdV  26.47 
 
 
314 aa  43.9  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.290153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  26.41 
 
 
316 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02710  membrane protein, putative  25.51 
 
 
530 aa  43.5  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.715916  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  23.2 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  20.18 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>