98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0577 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  100 
 
 
303 aa  577  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  46.58 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  46.78 
 
 
302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  44.18 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  45.89 
 
 
298 aa  211  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  39.13 
 
 
299 aa  211  2e-53  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  42.29 
 
 
305 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  40 
 
 
301 aa  176  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  38.61 
 
 
301 aa  170  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  40.07 
 
 
301 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  39.59 
 
 
301 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  40.61 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  35.71 
 
 
302 aa  157  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  30 
 
 
303 aa  150  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  35.2 
 
 
299 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  35.2 
 
 
299 aa  125  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  34.67 
 
 
337 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  34.67 
 
 
337 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  34.67 
 
 
337 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  34.87 
 
 
299 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  34.21 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 
302 aa  118  9.999999999999999e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  32.66 
 
 
300 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.52 
 
 
302 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
304 aa  99  9e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.57 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.68 
 
 
304 aa  96.3  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  25 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.57 
 
 
307 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.66 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.86 
 
 
301 aa  93.2  5e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.71 
 
 
306 aa  88.6  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  23.79 
 
 
302 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  28.67 
 
 
303 aa  86.3  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  31.09 
 
 
306 aa  85.5  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.17 
 
 
301 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.65 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  32.18 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  27.34 
 
 
304 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.53 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  26.14 
 
 
308 aa  63.9  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  22.63 
 
 
315 aa  63.5  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.16 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  29.39 
 
 
297 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.46 
 
 
312 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.59 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.86 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  31.96 
 
 
313 aa  57  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  23.39 
 
 
306 aa  57  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 
311 aa  56.2  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 
301 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  21.55 
 
 
316 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  26.64 
 
 
302 aa  55.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  27.44 
 
 
297 aa  54.3  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.69 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  29.23 
 
 
309 aa  53.5  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  30.95 
 
 
324 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  24.8 
 
 
322 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
322 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  26.78 
 
 
325 aa  51.2  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  28.06 
 
 
307 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 
302 aa  50.1  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  26.15 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  26.34 
 
 
318 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  25.97 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  25.55 
 
 
310 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  22.62 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  29.44 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3176  auxin efflux carrier  23.94 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  25.64 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  21.55 
 
 
296 aa  46.6  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  25.42 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  27.59 
 
 
329 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.24 
 
 
312 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.27 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0024  Auxin Efflux Carrier  29.46 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  22.6 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.74 
 
 
310 aa  45.8  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  28.42 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  26.27 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  26.27 
 
 
302 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.45 
 
 
328 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  28.32 
 
 
321 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  21.92 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  21.92 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  22.34 
 
 
305 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.42 
 
 
315 aa  43.5  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  28.08 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3529  auxin efflux carrier  33.04 
 
 
327 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.641646 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0560  permeases-like  27.52 
 
 
297 aa  43.1  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00020008  normal  0.118389 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.12 
 
 
304 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  24.04 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  22.7 
 
 
305 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  27.65 
 
 
314 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  25.79 
 
 
303 aa  42.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  22.6 
 
 
305 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>