181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0770 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
302 aa  580  1.0000000000000001e-165  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  32.65 
 
 
301 aa  171  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  32.09 
 
 
302 aa  169  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.46 
 
 
306 aa  168  8e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  33.57 
 
 
301 aa  166  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  34.78 
 
 
303 aa  154  2e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  32.32 
 
 
303 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  31.99 
 
 
303 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  33.67 
 
 
301 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  31.89 
 
 
301 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  30.9 
 
 
301 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  30.23 
 
 
301 aa  135  7.000000000000001e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  30.04 
 
 
303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  28.33 
 
 
298 aa  124  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  29.53 
 
 
302 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  30.43 
 
 
298 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  26.33 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.17 
 
 
305 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
299 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  27.01 
 
 
302 aa  105  7e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  28.42 
 
 
303 aa  104  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
300 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  29.55 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  24.08 
 
 
299 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  31.36 
 
 
304 aa  93.6  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  23.49 
 
 
299 aa  93.2  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.87 
 
 
304 aa  92.4  8e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  31.56 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  23.15 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  23.15 
 
 
299 aa  90.5  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  23.15 
 
 
337 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  23.15 
 
 
337 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  23.15 
 
 
337 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  24.07 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  31.84 
 
 
301 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  31.36 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  26.06 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  30.74 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  25.56 
 
 
315 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  30.35 
 
 
296 aa  79.3  0.00000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  26.47 
 
 
313 aa  75.9  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
320 aa  73.9  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  28.8 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  28 
 
 
318 aa  72.4  0.000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  30.88 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  26.27 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.89 
 
 
361 aa  65.5  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  22.8 
 
 
308 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.05 
 
 
305 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  23.08 
 
 
292 aa  63.9  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 
325 aa  62.8  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  25.62 
 
 
305 aa  62.8  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.48 
 
 
312 aa  62.4  0.000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.91 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
309 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  28.63 
 
 
297 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  22.26 
 
 
321 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  26.21 
 
 
309 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  24.66 
 
 
308 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 
309 aa  59.3  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  25 
 
 
285 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 
324 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25 
 
 
321 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  25.8 
 
 
301 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  23.9 
 
 
285 aa  58.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  21.15 
 
 
302 aa  57.8  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  30.28 
 
 
294 aa  58.2  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  23.17 
 
 
314 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  26.83 
 
 
317 aa  57.4  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.01 
 
 
322 aa  56.2  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
306 aa  55.8  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  21.94 
 
 
324 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.02 
 
 
315 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  32.24 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  32.24 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  24.21 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  29.17 
 
 
315 aa  55.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  33.09 
 
 
297 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  20.99 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  23.86 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.82 
 
 
315 aa  53.9  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  20.74 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  26.89 
 
 
297 aa  53.9  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  26.52 
 
 
325 aa  53.9  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.3 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  22.51 
 
 
313 aa  53.5  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.82 
 
 
313 aa  53.1  0.000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  23.55 
 
 
312 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  24.25 
 
 
291 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.32 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  26.94 
 
 
296 aa  52.8  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.3 
 
 
320 aa  52  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  26.85 
 
 
325 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  22.73 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  24.27 
 
 
312 aa  51.2  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.08 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>