178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2425 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  100 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  62.09 
 
 		 315 aa  332  6e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  47 
 
 		 304 aa  252  4.0000000000000004e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  48.85 
 
 		 305 aa  246  4e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  40.4 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.82 
 
 		 302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  35.05 
 
 		 318 aa  98.6  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  31.05 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  29.86 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  32.01 
 
 		 325 aa  79.3  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 315 aa  75.5  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  30.84 
 
 		 307 aa  74.3  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.22 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.09 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.17 
 
 		 315 aa  69.7  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 303 aa  69.3  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.61 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.66 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  27.03 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  29.68 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  28.94 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  24.65 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.28 
 
 		 332 aa  64.3  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.73 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  25.86 
 
 		 325 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.33 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  29.67 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 		 298 aa  62.8  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.32 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  27.67 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.41 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  26.12 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  29.8 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  24.92 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  21.71 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.11 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  28.04 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  24.9 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  22.83 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.81 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1242  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115852  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.51 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  27.23 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  23.57 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  23.57 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  28.15 
 
 		 330 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  27.61 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  22.95 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  23.57 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  20.28 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 		 297 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  22.51 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 318 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.71 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 308 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  27.9 
 
 		 316 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  27.55 
 
 		 295 aa  53.5  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 		 312 aa  53.5  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  23.57 
 
 		 303 aa  53.9  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  26.38 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  29.32 
 
 		 319 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.3 
 
 		 298 aa  53.1  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 324 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.02 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.87 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  24.58 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  29.85 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  26.53 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1593  auxin efflux carrier  22.95 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  26.33 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  25.66 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.45 
 
 		 305 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>