45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3336 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3336  auxin efflux carrier  100 
 
 		 321 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 304 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.61 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  28.11 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.93 
 
 		 301 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.83 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.53 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.15 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  22.89 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  22.07 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.16 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  27.18 
 
 		 315 aa  62.4  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  22.19 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  22.26 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23.75 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  25.62 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  20.27 
 
 		 303 aa  55.8  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  20.62 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  23.03 
 
 		 298 aa  51.6  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.08 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  24.66 
 
 		 305 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.11 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  22.63 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  22.63 
 
 		 305 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  21.53 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  22.63 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  22.5 
 
 		 327 aa  46.2  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  22.63 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 307 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25.11 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  24.66 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  22.57 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  35.29 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  22.05 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  24.8 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  23.85 
 
 		 332 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  23 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  23.25 
 
 		 308 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  24.44 
 
 		 313 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  21.98 
 
 		 295 aa  42.7  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>