203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0236 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  100 
 
 		 312 aa  623  1e-177  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  59.66 
 
 		 297 aa  381  1e-105  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  57.56 
 
 		 315 aa  361  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  41.03 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  40.71 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  41.21 
 
 		 315 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  34.88 
 
 		 328 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  35.76 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  35.26 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  34.46 
 
 		 327 aa  192  4e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  28.99 
 
 		 306 aa  134  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  28.83 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 361 aa  97.1  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  22.85 
 
 		 306 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25 
 
 		 317 aa  87.4  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  28.57 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  23.03 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  28.12 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  23.05 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  23.34 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  25.56 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.36 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25.24 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  24.43 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  28.06 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.2 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.46 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.2 
 
 		 318 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  21.82 
 
 		 316 aa  67.8  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  26.55 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  24.04 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.67 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  24.47 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  22.61 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  25.47 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.45 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.91 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  23.76 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  22.26 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  30.73 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  27.42 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  24.32 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  30.28 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  23.73 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  21.66 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  26.57 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  22.92 
 
 		 309 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  21.14 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  24.2 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  25.42 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  21.64 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  21.64 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  23 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.73 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  20.2 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  23.86 
 
 		 328 aa  57.4  0.0000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  21.31 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  22.3 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  26.91 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  20.27 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 291 aa  56.2  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  24.31 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  22.3 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  24.24 
 
 		 297 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  21.97 
 
 		 318 aa  55.8  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  22.58 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  24.26 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  24.42 
 
 		 312 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  25.43 
 
 		 316 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  25.46 
 
 		 308 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  21.3 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  19.57 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25.71 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23.81 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  24.19 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  22.37 
 
 		 367 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  22.56 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  24.39 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  27.72 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  22.48 
 
 		 297 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  21.85 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 		 319 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  23.04 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  28.24 
 
 		 300 aa  52.4  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  24.18 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>