202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1362 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  48.85 
 
 		 304 aa  254  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  48.03 
 
 		 304 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  51.63 
 
 		 315 aa  241  7.999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  41.88 
 
 		 313 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 302 aa  113  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  38.43 
 
 		 318 aa  109  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  30.77 
 
 		 305 aa  106  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.05 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29.35 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 303 aa  76.6  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  27.3 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  27.65 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.09 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.82 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.09 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28.05 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  24.59 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  30.2 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  25.81 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.33 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  29.77 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  28.14 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  27.53 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  28.47 
 
 		 297 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0363  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.422353  normal  0.710727 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  26.53 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.28 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  27.1 
 
 		 307 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  27.4 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  26.13 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  26.22 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  26.13 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  26.64 
 
 		 312 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 		 307 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.07 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  28.87 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.62 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1325  auxin efflux carrier  28 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.641195  normal  0.474825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  29.6 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0121  auxin efflux carrier  26.07 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  26.67 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2483  Auxin Efflux Carrier  27.5 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.315761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  27.15 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  28.31 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  26.71 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  27.52 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  25.71 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  27.99 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  23.76 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  27.51 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.95 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  23.89 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.43 
 
 		 291 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  23.89 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  23.89 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  27.6 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  22.59 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  27.92 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  25.41 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.06 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  22.74 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  23.9 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  21.91 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  26.94 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1405  putative transporter  27.33 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.419284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.3 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  30.82 
 
 		 317 aa  56.2  0.0000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  24.68 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  26.98 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0581  Auxin Efflux Carrier  27.62 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  28.44 
 
 		 314 aa  54.7  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  22.85 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.74 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 350 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1014  Auxin Efflux Carrier  24.79 
 
 		 306 aa  54.3  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.152875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 		 316 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  26.12 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.8 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  29.14 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 308 aa  53.9  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.5 
 
 		 306 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 330 aa  53.5  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  22.85 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>