134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_5018 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  100 
 
 
303 aa  595  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  42.67 
 
 
301 aa  227  2e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  38 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  36.54 
 
 
301 aa  203  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  39.26 
 
 
302 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  39.2 
 
 
301 aa  197  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  40 
 
 
298 aa  196  3e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  35.55 
 
 
299 aa  172  5e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  30.56 
 
 
300 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  32.31 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  29.67 
 
 
298 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  31.56 
 
 
305 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  30.59 
 
 
300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  31.76 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  26.82 
 
 
299 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  30.41 
 
 
303 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  26.49 
 
 
299 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  26.49 
 
 
299 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  26.49 
 
 
299 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  30.23 
 
 
302 aa  137  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  26.49 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  26.49 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  26.49 
 
 
337 aa  136  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  27.18 
 
 
306 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  30.38 
 
 
302 aa  97.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.12 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
304 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
307 aa  85.9  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.93 
 
 
302 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  27.71 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  27.56 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  26.86 
 
 
315 aa  78.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  28.88 
 
 
301 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.17 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28.52 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.93 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  27.93 
 
 
318 aa  75.1  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  24.32 
 
 
304 aa  68.9  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  26.44 
 
 
315 aa  66.2  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  25.73 
 
 
313 aa  65.1  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  25 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  26.91 
 
 
303 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  27.47 
 
 
303 aa  64.3  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  27.47 
 
 
303 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.04 
 
 
306 aa  63.5  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0244  Auxin Efflux Carrier  25.95 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  22.54 
 
 
304 aa  60.1  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.27 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  24.55 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  24.55 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.31 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  25.73 
 
 
308 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  23.41 
 
 
322 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  23.35 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  22.22 
 
 
310 aa  56.2  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 
316 aa  56.6  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.96 
 
 
297 aa  56.2  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  27.54 
 
 
321 aa  55.5  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.02 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  24.02 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 
325 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  25.35 
 
 
324 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.79 
 
 
328 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  17.89 
 
 
315 aa  54.3  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  23.74 
 
 
311 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.1 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  23.69 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  21.61 
 
 
318 aa  52.8  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  26.2 
 
 
337 aa  52.4  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  25.53 
 
 
322 aa  52.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  21.61 
 
 
318 aa  52.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  24.32 
 
 
312 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.32 
 
 
320 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.67 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  22.33 
 
 
320 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1840  hypothetical protein  22.27 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.126779  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  22.29 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  22.33 
 
 
320 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  23.15 
 
 
313 aa  51.6  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  22.01 
 
 
320 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  24.89 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  22.65 
 
 
320 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  22.14 
 
 
301 aa  50.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  22.54 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.49 
 
 
312 aa  50.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  21.9 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  22.9 
 
 
320 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.87 
 
 
318 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  29.84 
 
 
309 aa  50.4  0.00004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  23.25 
 
 
322 aa  49.7  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.16 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  23.47 
 
 
313 aa  49.7  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  22.63 
 
 
312 aa  49.3  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25.73 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  25.26 
 
 
307 aa  48.5  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  23.87 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.28 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.28 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>