113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1159 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  100 
 
 
299 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  41.67 
 
 
302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  40.34 
 
 
302 aa  217  2e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0265  hypothetical protein  36.9 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  39.86 
 
 
303 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  35.23 
 
 
298 aa  188  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  38.83 
 
 
301 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  33.89 
 
 
305 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  38.01 
 
 
303 aa  167  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  35.05 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  36.94 
 
 
301 aa  158  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  35.4 
 
 
301 aa  155  9e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  35.37 
 
 
301 aa  146  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  35.74 
 
 
298 aa  143  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  35.42 
 
 
301 aa  129  7.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1460  putative auxin efflux carrier  28 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0835  putative auxin efflux carrier  28 
 
 
299 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1848  auxin efflux carrier, putative  28 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2151  putative auxin efflux carrier  28 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0424  auxin efflux carrier family protein  28 
 
 
337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0521  auxin efflux carrier family protein  28 
 
 
299 aa  120  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  31.12 
 
 
302 aa  119  9e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2100  auxin efflux carrier, putative  27.67 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.939819  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  28.42 
 
 
300 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  28.96 
 
 
301 aa  113  5e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  31.51 
 
 
302 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  30.82 
 
 
303 aa  106  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  30.47 
 
 
303 aa  106  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  29.63 
 
 
302 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.48 
 
 
306 aa  97.8  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  30.04 
 
 
306 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  28.03 
 
 
308 aa  88.6  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  27.34 
 
 
303 aa  84  0.000000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.48 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  27.16 
 
 
309 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.99 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.4 
 
 
304 aa  75.9  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.83 
 
 
307 aa  75.9  0.0000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  30.43 
 
 
324 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  26.22 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.82 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  28.17 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  24.78 
 
 
315 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  24.74 
 
 
328 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  22.84 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  26.47 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  20.48 
 
 
297 aa  57.4  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  25.27 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  22.33 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.57 
 
 
312 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  26.34 
 
 
315 aa  54.7  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  22 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  25.17 
 
 
305 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3064  Auxin Efflux Carrier  24.16 
 
 
301 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.198977  hitchhiker  0.000102827 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.9 
 
 
297 aa  51.2  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.56 
 
 
304 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  27.82 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  26.15 
 
 
294 aa  50.4  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.06 
 
 
310 aa  49.7  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  23.72 
 
 
305 aa  49.7  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  23.61 
 
 
313 aa  49.3  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  21.84 
 
 
315 aa  49.3  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  30.41 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  25.12 
 
 
307 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  25.82 
 
 
309 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0520  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 
299 aa  48.9  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000302523  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  23.45 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  23.79 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  25.69 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  25.69 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  25.68 
 
 
311 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  23.79 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  23.79 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.15 
 
 
302 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1750  Auxin Efflux Carrier  24.29 
 
 
296 aa  47.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  24.71 
 
 
312 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  24.62 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  23.72 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  23.75 
 
 
329 aa  46.2  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  22.03 
 
 
324 aa  45.8  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  23.95 
 
 
310 aa  45.8  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1044  auxin efflux carrier  24.22 
 
 
322 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  26.59 
 
 
314 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  20.92 
 
 
320 aa  45.4  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  21.55 
 
 
315 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25.55 
 
 
302 aa  44.7  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  21.14 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.53 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  24.11 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  22.82 
 
 
297 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.1 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
309 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  28.87 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  24.89 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  22.99 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2771  Auxin Efflux Carrier  22.46 
 
 
310 aa  43.5  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>