83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1504 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  100 
 
 
315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  30.79 
 
 
328 aa  137  3.0000000000000003e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  27.27 
 
 
305 aa  102  7e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  24.35 
 
 
320 aa  79  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  21.43 
 
 
306 aa  75.1  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 
315 aa  71.2  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.64 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  23.9 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 
302 aa  62.4  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  24.08 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
361 aa  60.1  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.35 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  35.17 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.21 
 
 
304 aa  55.8  0.0000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  22.22 
 
 
314 aa  55.8  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.16 
 
 
310 aa  55.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.35 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.62 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.62 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.62 
 
 
318 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  26.92 
 
 
296 aa  54.7  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.97 
 
 
306 aa  55.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  26.28 
 
 
317 aa  54.3  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  26.94 
 
 
312 aa  54.3  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  27.01 
 
 
330 aa  53.5  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.1 
 
 
297 aa  53.1  0.000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.72 
 
 
304 aa  53.1  0.000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.59 
 
 
317 aa  52.8  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.76 
 
 
304 aa  52.8  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  24.38 
 
 
303 aa  52.8  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  26.6 
 
 
296 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  23.26 
 
 
327 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  20.89 
 
 
312 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  22.95 
 
 
315 aa  51.6  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  24.55 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  23.41 
 
 
306 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1194  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 
318 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  27.1 
 
 
313 aa  50.1  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  29.03 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  25.99 
 
 
319 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  19.47 
 
 
316 aa  49.3  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.53 
 
 
305 aa  49.3  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.22 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  25.79 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  26.97 
 
 
299 aa  48.5  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.81 
 
 
318 aa  48.9  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  29.87 
 
 
306 aa  48.9  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  24.53 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  27.88 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.71 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  21.82 
 
 
302 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.64 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  26.21 
 
 
302 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  30.4 
 
 
311 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  24.06 
 
 
305 aa  46.6  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  24.79 
 
 
311 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.88 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  21.63 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.88 
 
 
295 aa  46.6  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  22.93 
 
 
307 aa  46.2  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  22.7 
 
 
349 aa  45.8  0.0009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  26.28 
 
 
313 aa  45.8  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  21.73 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  22.7 
 
 
349 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25 
 
 
313 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  28.17 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  23.1 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  19.87 
 
 
299 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  27.16 
 
 
309 aa  44.3  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  25.53 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  25 
 
 
372 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  27.41 
 
 
324 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.76 
 
 
295 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  24.35 
 
 
313 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  26.03 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  22.41 
 
 
304 aa  43.5  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
313 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  23.53 
 
 
303 aa  42.7  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  26.37 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  25.41 
 
 
315 aa  42.7  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>