114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1052 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1052  auxin efflux carrier  100 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.951846  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  42.91 
 
 		 296 aa  244  9e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  42.91 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  43.54 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  29 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  28.96 
 
 		 302 aa  78.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 		 297 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 		 297 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 297 aa  73.9  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.6 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.05 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  25 
 
 		 295 aa  65.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  27.31 
 
 		 315 aa  63.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.32 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  26.3 
 
 		 312 aa  62.8  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  23.38 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  25.96 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2139  auxin efflux carrier  27.44 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.207426  normal  0.170483 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  24.65 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  25.52 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  24.44 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.4 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  24.18 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 295 aa  56.6  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0840  auxin efflux carrier  26.76 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0605901  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.51 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  24.41 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  28.03 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  30.05 
 
 		 308 aa  55.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.95 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  30.15 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.45 
 
 		 313 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  29 
 
 		 301 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 291 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  22.94 
 
 		 301 aa  52.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  27.04 
 
 		 318 aa  52.8  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  25.14 
 
 		 291 aa  52.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.51 
 
 		 315 aa  52.4  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  22.15 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  27.2 
 
 		 318 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.44 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  25.13 
 
 		 330 aa  51.2  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2628  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 340 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.926353  decreased coverage  0.0000380487 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  27.39 
 
 		 318 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  26.97 
 
 		 318 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  24.9 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  22.04 
 
 		 291 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  26.05 
 
 		 305 aa  49.7  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  21.84 
 
 		 313 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  25.77 
 
 		 315 aa  49.7  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  21.9 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.97 
 
 		 318 aa  49.7  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  26.36 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  26.36 
 
 		 318 aa  49.3  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  26.36 
 
 		 318 aa  48.9  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  26.89 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  27.4 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  24.53 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  24.53 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  21.5 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  22.61 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0290  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.392401  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  21.29 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25 
 
 		 299 aa  47.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  23.13 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.15 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.34 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  23.13 
 
 		 318 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2844  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 317 aa  46.6  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  21.9 
 
 		 313 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 316 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  24.89 
 
 		 306 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.76 
 
 		 320 aa  45.8  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  20.28 
 
 		 295 aa  45.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1159  auxin efflux carrier  25.38 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  22.33 
 
 		 319 aa  45.8  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  24.81 
 
 		 308 aa  45.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  23.45 
 
 		 291 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  25.48 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  21.45 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  22.4 
 
 		 316 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  24.91 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  26.99 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  24.58 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  24.5 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  21.89 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>