240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2327 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
316 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  67.62 
 
 
315 aa  436  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  65.4 
 
 
315 aa  416  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  40.71 
 
 
312 aa  258  1e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  42.63 
 
 
315 aa  257  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  40.68 
 
 
297 aa  240  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  34.17 
 
 
328 aa  222  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  33.33 
 
 
321 aa  188  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  33.86 
 
 
314 aa  185  7e-46  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  28.75 
 
 
327 aa  159  6e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  29.17 
 
 
306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 
306 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.05 
 
 
307 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  26.06 
 
 
361 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.82 
 
 
305 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  27.1 
 
 
318 aa  94  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  27.1 
 
 
318 aa  94  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  27.1 
 
 
318 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.71 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  27.07 
 
 
318 aa  92.4  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  26.43 
 
 
318 aa  92  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  26.11 
 
 
318 aa  92  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  24.69 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  22.56 
 
 
312 aa  89  9e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25 
 
 
304 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  21.12 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  23.73 
 
 
306 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  23.03 
 
 
317 aa  83.6  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.67 
 
 
307 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  24.26 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  23.96 
 
 
325 aa  79.3  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.83 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.76 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  23.45 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  23.79 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  26.85 
 
 
307 aa  73.2  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  21.15 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.83 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  22.87 
 
 
300 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  22.59 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  23.81 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
299 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  23.55 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  23.72 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  24.16 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  24.16 
 
 
318 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.15 
 
 
318 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  25 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  24.16 
 
 
318 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  23.15 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  20.23 
 
 
362 aa  63.9  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  22.47 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  19.81 
 
 
312 aa  64.3  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  23.15 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  23.15 
 
 
318 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  23.36 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  23.67 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.14 
 
 
306 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  27.54 
 
 
303 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  18.3 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  24.48 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  21.57 
 
 
295 aa  62.4  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  21.88 
 
 
319 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.83 
 
 
318 aa  62  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  22.04 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  22.07 
 
 
313 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  19.94 
 
 
319 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  23.38 
 
 
305 aa  60.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  28.39 
 
 
303 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  28.27 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  23.67 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  23.01 
 
 
349 aa  60.1  0.00000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  21.6 
 
 
320 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.07 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  22.04 
 
 
305 aa  59.7  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  21.74 
 
 
315 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  21.4 
 
 
313 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  19.87 
 
 
310 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  26.07 
 
 
298 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  21.18 
 
 
320 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  21.29 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  21.43 
 
 
313 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  26.23 
 
 
299 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  23.57 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  20.19 
 
 
320 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  22.71 
 
 
302 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  23.29 
 
 
318 aa  58.2  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  20.88 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  19.46 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  20.57 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  19.79 
 
 
319 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  20.57 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  23.96 
 
 
325 aa  57  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  22.01 
 
 
313 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.39 
 
 
301 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  22.97 
 
 
302 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  23.05 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  20.39 
 
 
315 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>