161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0304 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 304 aa  587  1e-167  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  47.06 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  48.85 
 
 		 315 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  48.03 
 
 		 305 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  40.2 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  31.18 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  35.43 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  29.29 
 
 		 305 aa  91.3  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.47 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  24.65 
 
 		 302 aa  79  0.00000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.19 
 
 		 306 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.86 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6049  auxin efflux carrier  25 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  29.58 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 		 301 aa  70.9  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  23.86 
 
 		 303 aa  70.9  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  26.15 
 
 		 315 aa  70.5  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  29.39 
 
 		 325 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  27.9 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.8 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  26.46 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0983  conserved hypothetical integral membrane protein, predicted permease  26.02 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.531799  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  21.95 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5018  auxin efflux carrier  21.97 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.320746  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  28.51 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  27 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.27 
 
 		 301 aa  63.9  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  24.03 
 
 		 307 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  24.01 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42100  hypothetical protein  27.81 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2009  Auxin Efflux Carrier  26.91 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  31.96 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  26.51 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  30 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1090  permease  26.4 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  28.42 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  31.48 
 
 		 299 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  28.25 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02282  predicted transporter  24.05 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02243  hypothetical protein  24.05 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 291 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2509  putative transporter YfdV  24.05 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.122299  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  23.68 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.08 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  30.19 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  27.74 
 
 		 307 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  28.33 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 291 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.17 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  25.32 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1249  auxin efflux carrier  25 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  30.06 
 
 		 321 aa  57  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  30.15 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.42 
 
 		 361 aa  56.6  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.3 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0577  auxin efflux carrier  27 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3571  hypothetical protein  27.39 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  28.09 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  30.42 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  26.67 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  26.59 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  23.72 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.2 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.81 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0469  Auxin Efflux Carrier  25.61 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  22.63 
 
 		 309 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 304 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.69 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  27.21 
 
 		 302 aa  55.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0853  Auxin Efflux Carrier  29.23 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  26.27 
 
 		 291 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.72 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.89 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  28.5 
 
 		 302 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  31.06 
 
 		 311 aa  53.9  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 317 aa  53.5  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  27.27 
 
 		 321 aa  53.1  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 279 aa  52.8  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  25.52 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  25.83 
 
 		 311 aa  52.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  25.52 
 
 		 310 aa  52.8  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  26.56 
 
 		 330 aa  52.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0806  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00330706  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0722  Auxin Efflux Carrier  25.61 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  31.25 
 
 		 314 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2190  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1589  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.436679 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  29.17 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.83 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  28.01 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1724  auxin efflux carrier  31 
 
 		 311 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0755332  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  29.41 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  24.63 
 
 		 305 aa  50.8  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  27.92 
 
 		 316 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 308 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  27.47 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>