More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0671 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  100 
 
 		 299 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  64.53 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 308 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  36.36 
 
 		 314 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2339  auxin efflux carrier  35.18 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  31.6 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  31.7 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  31.7 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  31.7 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  32.04 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  31.15 
 
 		 318 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 306 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  32.36 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  31.58 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  30.49 
 
 		 318 aa  113  5e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  30.8 
 
 		 312 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  33.9 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  30.66 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  29.84 
 
 		 318 aa  108  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  31.39 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  31.37 
 
 		 314 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  32.7 
 
 		 316 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1273  auxin efflux carrier  33.55 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  30.74 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2804  auxin efflux carrier  28.86 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.0046456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  30.29 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  31.25 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  29 
 
 		 315 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0918  auxin efflux carrier  32 
 
 		 310 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  30.85 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  28.67 
 
 		 329 aa  90.5  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  28.66 
 
 		 367 aa  90.1  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3161  Auxin Efflux Carrier  30.13 
 
 		 309 aa  89  8e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.303003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  30.17 
 
 		 313 aa  89  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  31.4 
 
 		 313 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  29.83 
 
 		 315 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  30.14 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  30.17 
 
 		 313 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2979  auxin efflux carrier  29.58 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.402882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3205  Auxin Efflux Carrier  29.58 
 
 		 309 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  29.83 
 
 		 313 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  30.64 
 
 		 314 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30060  predicted permease  31.16 
 
 		 306 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0636  auxin efflux carrier  32.76 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.233564  normal  0.128937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  31.89 
 
 		 318 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  29.11 
 
 		 314 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  31.77 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  30.59 
 
 		 313 aa  82  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2059  auxin efflux carrier  30.35 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0611643  normal  0.474606 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  31.89 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  30.14 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0140  auxin efflux carrier  30.71 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1882  Auxin Efflux Carrier  30.35 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0268  putative MdcF malonate transporter  31.94 
 
 		 321 aa  80.1  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.359135  normal  0.0190888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5096  auxin efflux carrier  28.72 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.353233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  32.42 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  27.15 
 
 		 305 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0188  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4280  auxin efflux carrier  31.27 
 
 		 330 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.182755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  31.19 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1027  transporter, putative  29.62 
 
 		 315 aa  77  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  23.62 
 
 		 315 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  32.4 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25.16 
 
 		 306 aa  75.1  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  27.46 
 
 		 310 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.43 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  28.79 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  30.56 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0231  auxin efflux carrier  33.44 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00153473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  27.63 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  21.26 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  30 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0129  malonate transporter, putative  30.34 
 
 		 330 aa  72.4  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0280835 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  31.76 
 
 		 311 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.54 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  25.72 
 
 		 315 aa  71.6  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 313 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  28.08 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  28.62 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 321 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  33.91 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  29.53 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  30.77 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1383  Auxin Efflux Carrier  27.84 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  30 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  30 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2420  Auxin Efflux Carrier  29.25 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  27.62 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  30.33 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4559  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 372 aa  67  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.418234  normal  0.987668 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  34.62 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>