50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_4274 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  100 
 
 		 329 aa  636    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  47.45 
 
 		 307 aa  253  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  29.22 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1289  Auxin Efflux Carrier  31.93 
 
 		 324 aa  113  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00114363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  30.73 
 
 		 302 aa  83.2  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  26.36 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  26.24 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1093  hypothetical protein  30.74 
 
 		 313 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.795782  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  27.35 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  34.27 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  25.25 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  27.36 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  27.65 
 
 		 304 aa  56.2  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.45 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  28.11 
 
 		 307 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23.94 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.7 
 
 		 311 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.96 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2425  auxin efflux carrier  25.35 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 301 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  30.37 
 
 		 320 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  26.82 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.96 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  25.11 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  26.24 
 
 		 315 aa  47.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2179  auxin efflux carrier  28.45 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0363  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 		 315 aa  47.4  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  0.150969 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  26.34 
 
 		 305 aa  46.2  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  26.03 
 
 		 302 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.63 
 
 		 316 aa  46.2  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.66 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  24.66 
 
 		 320 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.19 
 
 		 315 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.19 
 
 		 319 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  24.88 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4098  auxin efflux carrier  24.79 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.694441  normal  0.0141953 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  24.03 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 320 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1866  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  29.81 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  26.58 
 
 		 305 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.39 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 312 aa  42.7  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 306 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.22 
 
 		 297 aa  42.4  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.98 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  25.35 
 
 		 261 aa  42.7  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>