39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1276 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  100 
 
 		 261 aa  494  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  81.54 
 
 		 261 aa  347  1e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  81.96 
 
 		 261 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  67.5 
 
 		 261 aa  285  5e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  38.37 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  38.08 
 
 		 305 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  38.19 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  37.8 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  35.14 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  33.33 
 
 		 290 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.23 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  30 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.77 
 
 		 313 aa  58.9  0.00000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  32.14 
 
 		 325 aa  53.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  24.07 
 
 		 297 aa  53.9  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  25.63 
 
 		 308 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  29.38 
 
 		 306 aa  52.4  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  26.75 
 
 		 302 aa  52  0.000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  27.59 
 
 		 301 aa  52  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.93 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.49 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  24.41 
 
 		 315 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  20.55 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.55 
 
 		 305 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  20.24 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  25.58 
 
 		 320 aa  49.7  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  27.68 
 
 		 312 aa  49.3  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  23.04 
 
 		 361 aa  48.5  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  20.58 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4274  auxin efflux carrier  25.13 
 
 		 329 aa  47.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13529  normal  0.159694 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1362  auxin efflux carrier  26.92 
 
 		 305 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  27.42 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  24.64 
 
 		 321 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  25.34 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 304 aa  43.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  27.35 
 
 		 297 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  21.34 
 
 		 315 aa  42.7  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 322 aa  42.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 302 aa  42  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>