54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0478 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0478  permease  100 
 
 		 305 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  98.36 
 
 		 305 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  62.3 
 
 		 305 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  49.01 
 
 		 307 aa  275  5e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  43.38 
 
 		 304 aa  219  3.9999999999999997e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  41.69 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  38.19 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  39 
 
 		 261 aa  146  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  38.93 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  38.43 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  22.04 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  25.09 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  21.88 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  26.84 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.43 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.06 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.67 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  23.26 
 
 		 315 aa  52.8  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  24.1 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  26.34 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.73 
 
 		 328 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  21.5 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  21.6 
 
 		 315 aa  49.7  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.4 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.26 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.23 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  22.4 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  24.81 
 
 		 307 aa  49.3  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.58 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  22.71 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  21.01 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  34 
 
 		 312 aa  46.6  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  25.43 
 
 		 318 aa  46.6  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  23.72 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  35.44 
 
 		 312 aa  46.2  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  22.27 
 
 		 318 aa  46.2  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  23.23 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3083  auxin efflux carrier  23.1 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  22.53 
 
 		 291 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  22.74 
 
 		 291 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  24.51 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  23.48 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  24.22 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  22.62 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  23.41 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  29.91 
 
 		 297 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  26.24 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.11 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  24.4 
 
 		 309 aa  43.1  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  24.31 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.19 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  25.79 
 
 		 304 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  28.97 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>