194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1914 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  100 
 
 		 309 aa  602  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  49.16 
 
 		 299 aa  270  2e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  43.09 
 
 		 313 aa  245  8e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  33.33 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  30.42 
 
 		 306 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.12 
 
 		 305 aa  102  7e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  27.56 
 
 		 305 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  30.23 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  27.74 
 
 		 312 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  26.2 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  26.87 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  26.2 
 
 		 349 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  26.67 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  26.69 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  29.68 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  24.67 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 318 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  26.48 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.76 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  24.58 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.33 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  23.4 
 
 		 305 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  22.85 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  27.8 
 
 		 325 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  24.89 
 
 		 318 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.89 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  19.81 
 
 		 302 aa  67  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  25.4 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 		 320 aa  66.2  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.69 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  24.25 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  22.83 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.31 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  23.08 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.92 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  24.89 
 
 		 318 aa  62.8  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  29.9 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  25.63 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  26.09 
 
 		 315 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  25.81 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.89 
 
 		 318 aa  62  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  25.25 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1684  auxin efflux carrier  23.96 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  22.26 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  26.32 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.69 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.69 
 
 		 318 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  26.14 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  22.07 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  26.7 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.69 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  27.35 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  21.88 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  20.96 
 
 		 313 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  22.68 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  25.73 
 
 		 320 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  24.59 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  23.45 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2056  auxin efflux carrier  22.01 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.503376  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  24.24 
 
 		 303 aa  59.3  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  23.99 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  27.14 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  26.21 
 
 		 313 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  24.25 
 
 		 319 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  29.37 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  21.38 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  23.68 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  23.73 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  26.19 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  20.13 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  24.63 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  21.59 
 
 		 311 aa  56.2  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2573  auxin efflux carrier  25 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  21.68 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3716  Auxin Efflux Carrier  28.47 
 
 		 316 aa  55.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.81 
 
 		 328 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 320 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  23.37 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  24.61 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  25.73 
 
 		 313 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  24.67 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  26.11 
 
 		 293 aa  53.9  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  23.25 
 
 		 307 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0622  auxin efflux carrier  24.35 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138454 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  24.84 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  23.76 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.93 
 
 		 297 aa  54.3  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  25.64 
 
 		 311 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  23.14 
 
 		 315 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  25.15 
 
 		 361 aa  53.1  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  19.27 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  28.07 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  28.07 
 
 		 318 aa  53.1  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  23.43 
 
 		 305 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>