94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2443 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 
305 aa  599  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  27.27 
 
 
315 aa  107  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  28.1 
 
 
328 aa  89  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  26.35 
 
 
306 aa  84.7  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.48 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  21.05 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  23.32 
 
 
361 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25 
 
 
299 aa  69.3  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  24.52 
 
 
317 aa  68.9  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1194  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  25.33 
 
 
305 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  26.15 
 
 
306 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
312 aa  62.8  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.47 
 
 
305 aa  62  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  26.81 
 
 
326 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  20 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  22.9 
 
 
320 aa  60.1  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
314 aa  58.9  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  25.41 
 
 
319 aa  58.9  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  22.94 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  21.05 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  27.92 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  22.46 
 
 
297 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  21.16 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  23.36 
 
 
306 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  24.68 
 
 
304 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  28.12 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  22.97 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  23.23 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  20.53 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  32.65 
 
 
350 aa  53.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  24.44 
 
 
307 aa  53.1  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  24.08 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.13 
 
 
314 aa  52.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  19.08 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  28.77 
 
 
307 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  30.77 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0205  auxin efflux carrier  24.84 
 
 
295 aa  50.8  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.773418  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  23 
 
 
297 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  23 
 
 
297 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  24.13 
 
 
301 aa  49.7  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  23.78 
 
 
306 aa  49.7  0.00006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0719  auxin efflux carrier  23.76 
 
 
285 aa  49.7  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  23.41 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0695  auxin efflux carrier  24.11 
 
 
285 aa  49.3  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.229992  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0553  auxin efflux carrier  23.78 
 
 
312 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  20.78 
 
 
328 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  26.09 
 
 
318 aa  49.3  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  25.43 
 
 
297 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  23.63 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  24.92 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49900  permease  26.8 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.058462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  29.05 
 
 
306 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0677  malonate transporter MdcF  23.23 
 
 
312 aa  48.1  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2331  auxin efflux carrier  23.4 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.775606  normal  0.52163 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.88 
 
 
304 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0304  Auxin Efflux Carrier  27.01 
 
 
304 aa  47  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003704  membrane protein  25.16 
 
 
293 aa  47  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  22.26 
 
 
303 aa  46.6  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  25.48 
 
 
313 aa  46.6  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0790  Auxin Efflux Carrier  25.48 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_93051  AEC family transporter: auxin efflux  24.39 
 
 
381 aa  46.2  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.1098  normal  0.481543 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 
313 aa  45.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  22.22 
 
 
327 aa  46.2  0.0008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  22.26 
 
 
303 aa  46.2  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  21.88 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  23.28 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  29.31 
 
 
304 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3595  auxin efflux carrier  24.77 
 
 
310 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.802749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2040  Auxin Efflux Carrier  25.08 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  26.69 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  25.46 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  28.7 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  24.52 
 
 
309 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  26.5 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0100  hypothetical protein  27.27 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  28.35 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  28.81 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  28.81 
 
 
318 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  22.07 
 
 
304 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0540  auxin efflux carrier  22.01 
 
 
292 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25.79 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  31.62 
 
 
299 aa  43.5  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25.79 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3888  auxin efflux carrier  27.17 
 
 
307 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1522  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.95 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.919635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  16.13 
 
 
321 aa  42.7  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  26.19 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1605  auxin efflux carrier (AEC) family protein  26.95 
 
 
295 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  21.25 
 
 
304 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  23.59 
 
 
303 aa  42.7  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  30.28 
 
 
293 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>