69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2186 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 325 aa  644    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  45.85 
 
 		 361 aa  301  1e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  32.72 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  30.87 
 
 		 300 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  28.88 
 
 		 306 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.33 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  27.19 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 		 307 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  27.36 
 
 		 305 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  27.08 
 
 		 315 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 312 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.7 
 
 		 305 aa  94  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.9 
 
 		 306 aa  92.8  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  27.6 
 
 		 310 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  25.15 
 
 		 327 aa  85.1  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  23.29 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  25.08 
 
 		 297 aa  81.6  0.00000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  24.32 
 
 		 316 aa  80.1  0.00000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  27.02 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  26.35 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  24.68 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  23.05 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  27.24 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  27.24 
 
 		 349 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  25 
 
 		 313 aa  67.8  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  26.32 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.36 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 301 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 302 aa  66.2  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  21.55 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6747  auxin efflux carrier  27.22 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  25.97 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0431  auxin efflux carrier  26.86 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.57 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.97 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.33 
 
 		 328 aa  57  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  23.81 
 
 		 304 aa  57  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1694  hypothetical protein  25.4 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.332065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0770  Auxin Efflux Carrier  23.32 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000531114  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  22.22 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  22.64 
 
 		 326 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 		 302 aa  53.1  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  24.59 
 
 		 296 aa  51.6  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  23.85 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  24.92 
 
 		 302 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  23.74 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  22.09 
 
 		 305 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1322  auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.16 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00669722  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0082  hypothetical protein  23.61 
 
 		 318 aa  49.7  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2895  Auxin Efflux Carrier  25.91 
 
 		 302 aa  49.7  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.94546e-22 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  21.05 
 
 		 305 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0908  auxin efflux carrier  21.83 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1282  putative integral membrane protein  24.44 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000143985  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  29.91 
 
 		 301 aa  47.8  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  21.59 
 
 		 291 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  21.12 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  23.36 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  26.79 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  21.12 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  20.27 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00930  auxin efflux transporter family protein (Eurofung)  25.74 
 
 		 584 aa  43.1  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00307938  normal  0.241303 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  24.01 
 
 		 297 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 		 315 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  23.73 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  25.1 
 
 		 353 aa  42.7  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  21.28 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  20.28 
 
 		 291 aa  42.4  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>