108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0498 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0509  auxin efflux carrier family protein  99.71 
 
 		 349 aa  692    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0577752  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0498  auxin efflux carrier family protein  100 
 
 		 349 aa  693    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0231  Auxin Efflux Carrier  50.3 
 
 		 353 aa  295  6e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl378  putative malate permease  31.4 
 
 		 376 aa  141  9.999999999999999e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00181324  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  26.15 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13080  predicted permease  25.9 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.638391  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf736  hypothetical protein  25.11 
 
 		 453 aa  91.3  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.46 
 
 		 305 aa  90.5  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  25.94 
 
 		 325 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 		 320 aa  84.7  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  26.42 
 
 		 312 aa  84  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  23.95 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1647  hypothetical protein  24.48 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.435771  normal  0.0750907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  26.2 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  24.25 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0031  Auxin Efflux Carrier  23.17 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.91 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2105  Auxin Efflux Carrier  22.53 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.84 
 
 		 315 aa  72.8  0.000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.06 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  23.51 
 
 		 306 aa  72  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  23.49 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0417  auxin efflux carrier  21.84 
 
 		 301 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.229238  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.01 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 306 aa  65.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7123  Auxin Efflux Carrier  23.96 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  22.54 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0241  malonate transporter  24.12 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  24.05 
 
 		 302 aa  61.6  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.46 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  21.84 
 
 		 304 aa  60.1  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0830  permease  25 
 
 		 362 aa  59.3  0.00000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  22.7 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  22.22 
 
 		 318 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 318 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  23.93 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  22.22 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1198  auxin efflux carrier  28.34 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000200283  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  23.36 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  22.49 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  22.67 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  22.79 
 
 		 318 aa  56.2  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  23.57 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  23.25 
 
 		 320 aa  55.1  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  22.27 
 
 		 321 aa  54.7  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  23.25 
 
 		 320 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1673  auxin efflux carrier  23.15 
 
 		 321 aa  53.9  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.719295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3358  auxin efflux carrier  21.85 
 
 		 325 aa  53.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0125073 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 318 aa  53.5  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  22.97 
 
 		 320 aa  53.5  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  23.64 
 
 		 318 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1219  Auxin Efflux Carrier  23.63 
 
 		 320 aa  52.8  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0781123  normal  0.077527 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0034  Auxin Efflux Carrier  20.85 
 
 		 307 aa  52.4  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  21.36 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0034  auxin efflux carrier  24.71 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1331  auxin efflux carrier  20.63 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.209849  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3295  auxin efflux carrier  23.92 
 
 		 320 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0975873  decreased coverage  0.0000962447 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  21.26 
 
 		 315 aa  52  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  21.81 
 
 		 330 aa  51.6  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1678  Auxin Efflux Carrier  22.8 
 
 		 300 aa  51.2  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1189  auxin efflux carrier  21.2 
 
 		 332 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000379435  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3152  auxin efflux carrier  23.63 
 
 		 320 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00120095  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  22.54 
 
 		 318 aa  50.4  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  20 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  20.94 
 
 		 315 aa  50.1  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3150  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.858662  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  21.59 
 
 		 311 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1322  auxin efflux carrier  24.64 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  20.77 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0404  Auxin Efflux Carrier  21.85 
 
 		 313 aa  48.5  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.989352  normal  0.549528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  22.28 
 
 		 319 aa  48.1  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2770  auxin efflux carrier  22.83 
 
 		 320 aa  48.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.600213  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  22.49 
 
 		 315 aa  47.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  27.33 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0419  putative citrate transporter  21.51 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  22.49 
 
 		 311 aa  47.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4150  putative malonate transporter  23.29 
 
 		 317 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  22.55 
 
 		 296 aa  46.2  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  24.46 
 
 		 311 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  21.72 
 
 		 328 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  22.99 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03581  possible malate permease  21.45 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1387  Auxin Efflux Carrier  26.19 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000312967  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22310  Auxin Efflux Carrier  21.97 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  23.01 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48340  Auxin Efflux Carrier family protein  24.56 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.378131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  22.39 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1282  auxin efflux carrier  20.93 
 
 		 322 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000676976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  21.94 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  25.22 
 
 		 318 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0756  putative integral membrane protein  25.95 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000863608  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1994  Auxin Efflux Carrier  21.85 
 
 		 312 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3876  auxin efflux carrier  25.75 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.573481  normal  0.565732 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  23.53 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4042  auxin efflux carrier  24.77 
 
 		 311 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  23.53 
 
 		 318 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>