231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0831 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  81.47 
 
 		 316 aa  503  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  81.15 
 
 		 316 aa  499  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  77.32 
 
 		 313 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  77.32 
 
 		 313 aa  478  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  77 
 
 		 315 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  77.64 
 
 		 313 aa  475  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  69.65 
 
 		 313 aa  446  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  69.97 
 
 		 313 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  56.87 
 
 		 315 aa  352  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  55.84 
 
 		 316 aa  325  7e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  41.58 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  42.81 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  43.59 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  43.65 
 
 		 318 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  39.94 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  42.16 
 
 		 318 aa  215  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  42.16 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  39.8 
 
 		 318 aa  215  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  42.16 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  43.32 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  43.32 
 
 		 318 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  39.67 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  41.56 
 
 		 318 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  40.65 
 
 		 316 aa  209  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  41.03 
 
 		 330 aa  208  7e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  37.7 
 
 		 319 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  40.85 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  41.1 
 
 		 318 aa  186  4e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  39.62 
 
 		 316 aa  179  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  40 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  40 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  40.33 
 
 		 318 aa  175  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  35.57 
 
 		 313 aa  171  1e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  38.49 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  32.38 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  35.96 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  36.54 
 
 		 302 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  35.57 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  33.79 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  36.54 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  31.13 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  30.2 
 
 		 302 aa  112  6e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  31.47 
 
 		 309 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  26.6 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  27.18 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  29.54 
 
 		 339 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  29.24 
 
 		 310 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  31.58 
 
 		 305 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  29.24 
 
 		 336 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  30.27 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  30.32 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  30.32 
 
 		 336 aa  99.8  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  27.92 
 
 		 310 aa  98.2  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  28.71 
 
 		 308 aa  96.3  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  30.33 
 
 		 306 aa  94  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  31.16 
 
 		 304 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 315 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  30 
 
 		 305 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  30.82 
 
 		 314 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  31.1 
 
 		 308 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  32.3 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  30.07 
 
 		 310 aa  87.4  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0671  auxin efflux carrier  30.51 
 
 		 299 aa  87  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.181249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  28.52 
 
 		 308 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  24.83 
 
 		 302 aa  84  0.000000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  26.49 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  26.13 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  29.47 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  26.62 
 
 		 303 aa  82.8  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  26.83 
 
 		 301 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  26.28 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  26.13 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.95 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  30.04 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  27.55 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  26.6 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  26.49 
 
 		 362 aa  80.1  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  25.66 
 
 		 315 aa  80.1  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  27.63 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  30.18 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  26.92 
 
 		 273 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  27.11 
 
 		 310 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  24.4 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3829  auxin efflux carrier  26.58 
 
 		 311 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.294332  normal  0.579025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  23.86 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  24.58 
 
 		 330 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  26.15 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  25.6 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  28.44 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.82 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.82 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.82 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  27.59 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3945  auxin efflux carrier  25.85 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0143831  normal  0.143049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  28.77 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  27.31 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  28.31 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  28.87 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  29.18 
 
 		 300 aa  68.9  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>