65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_12031 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_12031  permease  100 
 
 
305 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0478  permease  62.3 
 
 
305 aa  346  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.357892  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11981  hypothetical protein  61.97 
 
 
305 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.944523  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05181  AEC family transporter  50.99 
 
 
307 aa  285  7e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1803  AEC family transporter  47.02 
 
 
304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.362237 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0852  AEC family transporter  43.93 
 
 
290 aa  201  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.670822  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1276  ABC transporter  38.08 
 
 
261 aa  158  9e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13681  AEC family transporter  42.32 
 
 
261 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.02494  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13761  AEC family transporter  40.54 
 
 
261 aa  147  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13471  AEC family transporter  39.42 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  26.71 
 
 
306 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  23.38 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  23.12 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0368  auxin efflux carrier  22.29 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3581  auxin efflux carrier  26 
 
 
308 aa  62.4  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0109429 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0454  Auxin Efflux Carrier  21.55 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.815375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  22.33 
 
 
312 aa  55.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.92 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  25.81 
 
 
299 aa  52.8  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1433  Auxin Efflux Carrier  24.22 
 
 
320 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.138379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  25.86 
 
 
305 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  26.09 
 
 
305 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02940  Auxin Efflux Carrier  24.18 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  26.09 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  26.09 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  26.09 
 
 
305 aa  50.8  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1792  Auxin Efflux Carrier  25.42 
 
 
302 aa  50.8  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  25.6 
 
 
305 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25.85 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  30.43 
 
 
314 aa  49.7  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1082  auxin efflux carrier  29.47 
 
 
302 aa  48.5  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.355674 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  24.78 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  26.01 
 
 
301 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0496  auxin efflux carrier  23.22 
 
 
296 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0520  auxin efflux carrier  23.22 
 
 
296 aa  47.8  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00692662  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  25.6 
 
 
305 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1446  AEC family permease  24.64 
 
 
315 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0872  auxin efflux carrier  29.13 
 
 
312 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  25.12 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  25.88 
 
 
309 aa  47  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  25.71 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1828  Auxin Efflux Carrier  22.12 
 
 
320 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255201  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  26.46 
 
 
308 aa  45.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0214  hypothetical protein  24.92 
 
 
307 aa  45.4  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.756103 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  21.71 
 
 
309 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  24.15 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1602  auxin efflux carrier  21.5 
 
 
293 aa  45.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1015  hypothetical protein  23.89 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  28.18 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0033  auxin efflux carrier (AEC) family protein  24.88 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  21.79 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1038  auxin efflux carrier  23.38 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0954  hypothetical protein  24.57 
 
 
303 aa  43.9  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000019077  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2186  Auxin Efflux Carrier  24.28 
 
 
325 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  25.71 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3461  transporter, putative  27.23 
 
 
319 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  31.73 
 
 
297 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0706  Auxin Efflux Carrier  23.77 
 
 
326 aa  43.5  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  26.34 
 
 
320 aa  43.5  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  23.13 
 
 
291 aa  43.1  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  23.92 
 
 
314 aa  42.7  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  23.67 
 
 
302 aa  42.7  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  27.04 
 
 
320 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0718  Auxin Efflux Carrier  21.13 
 
 
318 aa  42.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0946  Auxin Efflux Carrier  30.49 
 
 
312 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.51689  hitchhiker  0.000246572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>