40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0173 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  100 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  38.49 
 
 
309 aa  245  9e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  40.53 
 
 
304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  39.2 
 
 
305 aa  223  3e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  32.56 
 
 
308 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  30.82 
 
 
308 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  31.08 
 
 
309 aa  167  2e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  31.54 
 
 
309 aa  132  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  26.33 
 
 
303 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  27.21 
 
 
301 aa  100  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  26.82 
 
 
307 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  24.36 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  22.76 
 
 
302 aa  63.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.2 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  23 
 
 
305 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.28 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  23.33 
 
 
305 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.96 
 
 
297 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  22.67 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  25.65 
 
 
297 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  23.97 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  22.67 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  23.63 
 
 
305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  22.67 
 
 
305 aa  55.8  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  22.67 
 
 
305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  22 
 
 
305 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  22.78 
 
 
325 aa  52.8  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2739  Auxin Efflux Carrier  23.45 
 
 
322 aa  50.4  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.428728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4411  auxin efflux carrier  26.94 
 
 
301 aa  48.9  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00604354  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  23.67 
 
 
304 aa  48.1  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4586  auxin efflux carrier  25.31 
 
 
328 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  20.98 
 
 
307 aa  46.6  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2284  hypothetical protein  23.02 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2325  hypothetical protein  23.02 
 
 
302 aa  45.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  22.22 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  22.07 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  21.93 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  21.93 
 
 
318 aa  43.1  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  23.43 
 
 
318 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12031  permease  23.13 
 
 
305 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.194304 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>