49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3151 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  100 
 
 
309 aa  601  1.0000000000000001e-171  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  50.84 
 
 
308 aa  256  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  37.54 
 
 
308 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  36.79 
 
 
309 aa  220  3e-56  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  37.16 
 
 
303 aa  181  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  36.14 
 
 
309 aa  177  2e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  33.45 
 
 
304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  38.35 
 
 
301 aa  172  5e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  32.77 
 
 
305 aa  170  3e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  31.08 
 
 
304 aa  153  4e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  24.57 
 
 
307 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  27.05 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  23.91 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  24.74 
 
 
305 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  23.73 
 
 
305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  25.34 
 
 
305 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  24.4 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  24.4 
 
 
305 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  24.4 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  26.98 
 
 
302 aa  63.2  0.000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  24.08 
 
 
305 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  23.37 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3450  auxin efflux carrier  25.23 
 
 
307 aa  57.4  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2559  auxin efflux carrier  24.68 
 
 
309 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  26.03 
 
 
313 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  21.23 
 
 
311 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  25.89 
 
 
302 aa  52.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  28.4 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  25.48 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3839  auxin efflux carrier  24.58 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24.2 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  25.48 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.82 
 
 
301 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  23.44 
 
 
297 aa  49.7  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3124  auxin efflux carrier  24.04 
 
 
309 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.757065  hitchhiker  0.00154101 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4791  auxin efflux carrier  22.11 
 
 
302 aa  48.9  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.309639  normal  0.321284 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3807  auxin efflux carrier  22.22 
 
 
295 aa  47  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.826316  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  23.7 
 
 
311 aa  47  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0432  Auxin Efflux Carrier  23.61 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  22.52 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  21.38 
 
 
350 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  23.58 
 
 
305 aa  44.3  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  22.71 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4185  auxin efflux carrier  27.36 
 
 
295 aa  43.9  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  23.87 
 
 
318 aa  43.9  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  24.68 
 
 
315 aa  43.1  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1793  auxin efflux carrier  24.04 
 
 
306 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.738901  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1641  Auxin Efflux Carrier  23.36 
 
 
320 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.206131  normal  0.299432 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  23.87 
 
 
318 aa  42.4  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>