209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2471 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2471  auxin efflux carrier  100 
 
 
315 aa  613  1e-175  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12580  membrane protein, Auxin Efflux Carrier family  59.74 
 
 
313 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0849  auxin efflux carrier  60.38 
 
 
313 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589934  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4289  auxin efflux carrier  58.15 
 
 
313 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0926  auxin efflux carrier  56.83 
 
 
315 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0966  auxin efflux carrier  57.19 
 
 
313 aa  359  4e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.842847  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0932  auxin efflux carrier  56.87 
 
 
313 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0831  auxin efflux carrier  56.87 
 
 
313 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.319812  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4479  hypothetical protein  54.95 
 
 
316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4170  auxin efflux carrier  54.63 
 
 
316 aa  338  7e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.91017  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  55.13 
 
 
316 aa  335  5e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  41.86 
 
 
318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  41.04 
 
 
318 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  40.72 
 
 
318 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  40.72 
 
 
318 aa  223  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2620  hypothetical protein  41.88 
 
 
318 aa  223  4e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  39.74 
 
 
318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  39.74 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  42.07 
 
 
318 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  40.07 
 
 
318 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  39.4 
 
 
318 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  39.74 
 
 
318 aa  217  2e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  39.4 
 
 
318 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  38.75 
 
 
318 aa  215  9e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  40.44 
 
 
330 aa  210  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0153  Auxin Efflux Carrier  43 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  40.26 
 
 
316 aa  201  1.9999999999999998e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3009  Auxin Efflux Carrier  36.45 
 
 
319 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0840632  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1263  Auxin Efflux Carrier  35.16 
 
 
319 aa  179  5.999999999999999e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.508295  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  37.76 
 
 
313 aa  178  8e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  38.24 
 
 
319 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  38.8 
 
 
295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2785  auxin efflux carrier  37.7 
 
 
312 aa  161  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000625681  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0732  permease  34.8 
 
 
319 aa  160  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1780  auxin efflux carrier  40.59 
 
 
302 aa  160  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0290107  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  37.82 
 
 
318 aa  157  3e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  38.24 
 
 
318 aa  156  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  38.24 
 
 
318 aa  155  6e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  36.96 
 
 
318 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  30.65 
 
 
315 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1956  permease  34.92 
 
 
317 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2093  auxin efflux carrier  25.86 
 
 
308 aa  100  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0633524 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  29.97 
 
 
309 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  26.19 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  28.67 
 
 
307 aa  95.5  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  29.04 
 
 
308 aa  95.1  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  26.49 
 
 
302 aa  92.8  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  29.35 
 
 
308 aa  92.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  28.24 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  29.85 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  29.85 
 
 
336 aa  89.4  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  27.93 
 
 
301 aa  89.4  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  28.86 
 
 
310 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  27.6 
 
 
311 aa  86.3  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  28.36 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  28.96 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3912  Auxin Efflux Carrier  27.7 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  28.72 
 
 
339 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  29.81 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  28.33 
 
 
310 aa  82.4  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  28.15 
 
 
317 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  25.68 
 
 
330 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 
297 aa  79.7  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  26.76 
 
 
305 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  27.24 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  26.13 
 
 
311 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2492  auxin efflux carrier  27.43 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0613  Auxin Efflux Carrier  25.09 
 
 
302 aa  76.3  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  22.99 
 
 
310 aa  76.3  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  24 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  25.59 
 
 
305 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  28.62 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1484  auxin efflux carrier  27.85 
 
 
309 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  28.27 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  28.77 
 
 
315 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  26.82 
 
 
305 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  28.57 
 
 
315 aa  74.3  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0141  malate permease  27.43 
 
 
321 aa  72.4  0.000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000545032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  24.75 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  29.41 
 
 
314 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  29.08 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0009  auxin efflux carrier  25.08 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000222862 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  25.68 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0880  hypothetical protein  24.06 
 
 
317 aa  69.3  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000839852  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2151  Auxin Efflux Carrier  25 
 
 
302 aa  68.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3917  auxin efflux carrier  24.75 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250713  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  25.51 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44490  Auxin efflux carrier family protein  26.47 
 
 
311 aa  67.8  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  27.43 
 
 
273 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  29.17 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  26.28 
 
 
350 aa  67.4  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2782  auxin efflux carrier  25 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350869  normal  0.279709 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1323  Auxin Efflux Carrier  25.45 
 
 
337 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00589859 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  27.49 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  25.83 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  28.72 
 
 
304 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  25 
 
 
306 aa  66.2  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  23.36 
 
 
302 aa  65.1  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2640  auxin efflux carrier  24.58 
 
 
291 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  26.63 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>