52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0767 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0767  auxin efflux carrier family protein  100 
 
 		 308 aa  595  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0428059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3151  auxin efflux carrier  50.84 
 
 		 309 aa  292  4e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0249  hypothetical protein  36.96 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.340267  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0792  auxin efflux carrier  41.06 
 
 		 305 aa  205  7e-52  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0184958  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0212  putative transporter  38.74 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3113  auxin efflux carrier  33.45 
 
 		 308 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.918617  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0173  putative transporter  34.22 
 
 		 304 aa  180  2.9999999999999997e-44  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0393  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 309 aa  172  7.999999999999999e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.193838  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0767  auxin efflux carrier  34.55 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.223185  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0947  hypothetical protein  35.94 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.203373  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5541  Auxin Efflux Carrier  25.86 
 
 		 307 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.642823  normal  0.193428 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0538  Auxin Efflux Carrier  28.19 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.163625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0937  Auxin Efflux Carrier  27.76 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2787  Auxin Efflux Carrier  24.67 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2172  hypothetical protein  25.73 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  24.76 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1984  auxin efflux carrier  25.58 
 
 		 305 aa  56.6  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0341  auxin efflux carrier  25.91 
 
 		 302 aa  56.2  0.0000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00467226  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3169  hypothetical protein  25.58 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1197  AEC family permease  22.41 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.626498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1991  hypothetical protein  25.24 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0127991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2139  hypothetical protein  25.24 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.369833  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1965  hypothetical protein  26.21 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0511973  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1943  hypothetical protein  26.21 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0422638  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2287  hypothetical protein  24.52 
 
 		 305 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  24 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2146  hypothetical protein  24.27 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2327  Auxin Efflux Carrier  26.39 
 
 		 316 aa  50.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  25 
 
 		 308 aa  49.3  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1917  auxin efflux carrier  22.66 
 
 		 310 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1914  auxin efflux carrier  27.2 
 
 		 309 aa  49.3  0.00008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1918  Auxin Efflux Carrier  26.65 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.032673  normal  0.548499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0069  auxin efflux carrier  29.79 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130998 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  26.67 
 
 		 305 aa  47.4  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0327  auxin efflux carrier  24.75 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1894  Auxin Efflux Carrier  25.47 
 
 		 297 aa  45.8  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2999  Auxin Efflux Carrier  22.09 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2164  auxin efflux carrier  19.78 
 
 		 321 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.232164  normal  0.102668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  23.38 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1171  auxin efflux carrier  24.55 
 
 		 320 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.864828  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0295  auxin efflux carrier  23.78 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1105  auxin efflux carrier  24.55 
 
 		 320 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.514443 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1479  Auxin Efflux Carrier  23.25 
 
 		 307 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1105  transporter, putative  24.55 
 
 		 320 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0344  auxin efflux carrier  25.62 
 
 		 307 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1629  auxin efflux carrier  23.82 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  25.85 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2049  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.633484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2510  auxin efflux carrier  21.96 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.894975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0851  AEC family transporter  21.96 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0399976  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0152  Auxin Efflux Carrier  22.52 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.357013  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1778  auxin efflux carrier  25.71 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>