224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1143 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1143  auxin efflux carrier  100 
 
 		 305 aa  577  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2024  hypothetical protein  66.3 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.912483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1173  auxin efflux carrier  56.95 
 
 		 330 aa  295  9e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.397411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1308  auxin efflux carrier  54.88 
 
 		 317 aa  292  5e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0901  Auxin Efflux Carrier  54.55 
 
 		 305 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0986  auxin efflux carrier  54.55 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5119  auxin efflux carrier  52.19 
 
 		 362 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95145  normal  0.866321 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1714  auxin efflux carrier  54.88 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3460  Auxin Efflux Carrier  54.88 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.548136  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2655  auxin efflux carrier  55.7 
 
 		 332 aa  256  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.615646  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3195  auxin efflux carrier  55.89 
 
 		 301 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0523  auxin efflux carrier  45.76 
 
 		 350 aa  235  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0807881  hitchhiker  0.00301444 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0581  auxin efflux carrier  45.36 
 
 		 312 aa  219  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0262  auxin efflux carrier  44.56 
 
 		 299 aa  196  5.000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1750  Auxin Efflux Carrier  39.51 
 
 		 297 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.614347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0360  auxin efflux carrier  37.5 
 
 		 311 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.335711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3182  auxin efflux carrier  40.2 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6264  hypothetical protein  38.38 
 
 		 304 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72140  hypothetical protein  38.38 
 
 		 314 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.58281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1207  permease  35.12 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6839  Auxin Efflux Carrier  32.66 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0672  auxin efflux carrier  36.42 
 
 		 306 aa  137  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01790  hypothetical protein  43.82 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.339933  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0872  auxin efflux carrier  35.12 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2254  auxin efflux carrier  33.56 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.984724  normal  0.611855 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1095  hypothetical protein  31.27 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1893  auxin efflux carrier  33.78 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.288901  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4206  auxin efflux carrier  33.1 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.220524 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1694  auxin efflux carrier  32.85 
 
 		 339 aa  124  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.598022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4722  hypothetical protein  36.24 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4049  auxin efflux carrier  33.21 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3732  auxin efflux carrier  32.75 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4317  auxin efflux carrier  33.21 
 
 		 336 aa  122  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0938  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.451063  normal  0.354086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4440  auxin efflux carrier  38.49 
 
 		 301 aa  120  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0289  Auxin Efflux Carrier  33.78 
 
 		 305 aa  119  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0308  Auxin Efflux Carrier  34.56 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000511331  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2484  auxin efflux carrier  35.25 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3561  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 315 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2213  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2840  auxin efflux carrier  32.99 
 
 		 304 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2360  auxin efflux carrier  35.14 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.630214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1709  auxin efflux carrier  34.58 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.203073 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2696  auxin efflux carrier  33.22 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.143953  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3143  auxin efflux carrier  36 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00177686  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1531  auxin efflux carrier  26.25 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.767129 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0389  auxin efflux carrier  35.48 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3536  auxin efflux carrier  32.06 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0587883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0537  auxin efflux carrier  30.96 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3856  Auxin Efflux Carrier  28.29 
 
 		 318 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1205  Auxin Efflux Carrier  32.31 
 
 		 304 aa  89.4  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1536  Auxin Efflux Carrier  23.95 
 
 		 315 aa  89  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000311444  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1027  putative permease  28.18 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000190415  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0130  Auxin Efflux Carrier  28.2 
 
 		 318 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1694  Auxin Efflux Carrier  30.07 
 
 		 303 aa  85.9  8e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0122  Auxin Efflux Carrier  28.85 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4086  Auxin Efflux Carrier  25.9 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0818  Auxin Efflux Carrier  33.88 
 
 		 273 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3921  auxin efflux carrier  32.44 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0128  permease  27.65 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4406  Auxin Efflux Carrier  25.57 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2873  auxin efflux carrier  27.4 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.393378  normal  0.0178409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4040  Auxin Efflux Carrier  27.87 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3957  auxin efflux carrier  25.68 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.049137  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3650  auxin efflux carrier (AEC) family transporter  25.68 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.428256 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0261  transporter, auxin efflux carrier (AEC) family protein  25.68 
 
 		 318 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0985  membrane transport protein, putative auxin efflux carrier  23.61 
 
 		 318 aa  73.2  0.000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.34086  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09770  predicted permease  26.28 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.554109 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1759  hypothetical protein  25.76 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00915167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0109  hypothetical protein  26.44 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1153  auxin efflux carrier  28.38 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.780124  normal  0.895088 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1654  auxin efflux carrier  25.42 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000818504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3424  auxin efflux carrier  25.08 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2221  auxin efflux carrier  25.42 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000697769  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1729  auxin efflux carrier  25.42 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000582172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1298  auxin efflux carrier  28.98 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00695256  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3604  auxin efflux carrier  29.08 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.610122  normal  0.279857 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0412  auxin efflux carrier family protein  28.98 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000402279  hitchhiker  0.00115892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2889  auxin efflux carrier  29.87 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.592206  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003892  transporter  25.17 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01768  hypothetical protein  24.16 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1885  Auxin Efflux Carrier  23.62 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000274794  hitchhiker  0.00457022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2459  auxin efflux carrier  23.62 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000221957  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1431  auxin efflux carrier  27.8 
 
 		 305 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00125479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2466  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000408156  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1191  auxin efflux carrier family protein  28.62 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567978  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3242  Auxin Efflux Carrier  32.68 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2579  auxin efflux carrier  23.3 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000223779  normal  0.0899714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2148  auxin efflux carrier  29.51 
 
 		 314 aa  65.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.992765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0559  auxin efflux carrier  29.65 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1182  auxin efflux carrier  26.12 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0886  auxin efflux carrier  25.84 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.41857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0051  auxin efflux carrier  28.29 
 
 		 313 aa  63.2  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1239  AEC family transporter  28.36 
 
 		 295 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.55367  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5865  Auxin Efflux Carrier  28.86 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02111  hypothetical protein  28.33 
 
 		 292 aa  62.4  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3864  auxin efflux carrier  29.49 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.256165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3137  Auxin Efflux Carrier  29.49 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0378351  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2027  putative malonate transporter  29 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2042  auxin efflux carrier  30.13 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00987949  normal  0.16087 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>